Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1R4

Il34, Interleukin-34, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il34Q8R1R4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Il34Q8R1R4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Il34Q8R1R4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Il34Q8R1R4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Il34Q8R1R4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Il34Q8R1R4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Il34Q8R1R4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Il34Q8R1R4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Il34Q8R1R4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Il34Q8R1R4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Il34Q8R1R4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Il34Q8R1R4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Il34Q8R1R4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Il34Q8R1R4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Il34Q8R1R4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Il34Q8R1R4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Il34Q8R1R4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Il34Q8R1R4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Il34Q8R1R4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Il34Q8R1R4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Il34Q8R1R4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Il34Q8R1R4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Il34Q8R1R4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Il34Q8R1R4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Il34Q8R1R4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Il34Q8R1R4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Il34Q8R1R4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Il34Q8R1R4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Il34Q8R1R4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Il34Q8R1R4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Il34Q8R1R4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Il34Q8R1R4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Il34Q8R1R4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Il34Q8R1R4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Il34Q8R1R4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Il34Q8R1R4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Il34Q8R1R4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Il34Q8R1R4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Il34Q8R1R4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Il34Q8R1R4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Il34Q8R1R4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Il34Q8R1R4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Il34Q8R1R4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Il34Q8R1R4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Il34Q8R1R4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Il34Q8R1R4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Il34Q8R1R4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Il34Q8R1R4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Il34Q8R1R4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Il34Q8R1R4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Il34Q8R1R4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Il34Q8R1R4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Il34Q8R1R4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Il34Q8R1R4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Il34Q8R1R4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Il34Q8R1R4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Il34Q8R1R4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Il34Q8R1R4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Il34Q8R1R4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Il34Q8R1R4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il34Q8R1R4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Il34Q8R1R4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Il34Q8R1R4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Il34Q8R1R4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Il34Q8R1R4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Il34Q8R1R4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il34Q8R1R4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Il34Q8R1R4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Il34Q8R1R4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Il34Q8R1R4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Il34Q8R1R4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Il34Q8R1R4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Il34Q8R1R4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Il34Q8R1R4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Il34Q8R1R4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Il34Q8R1R4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Il34Q8R1R4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Il34Q8R1R4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Il34Q8R1R4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Il34Q8R1R4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Il34Q8R1R4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Il34Q8R1R4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il34Q8R1R4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Il34Q8R1R4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Il34Q8R1R4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il34Q8R1R4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il34Q8R1R4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Il34Q8R1R4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Il34Q8R1R4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Il34Q8R1R4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Il34Q8R1R4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Il34Q8R1R4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms