Protein–RNA interactions for Protein: Q3U497

Cd300lb, CMRF35-like molecule 7, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lbQ3U497 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Cd300lbQ3U497 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Cd300lbQ3U497 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Cd300lbQ3U497 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Cd300lbQ3U497 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Cd300lbQ3U497 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Cd300lbQ3U497 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Cd300lbQ3U497 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Cd300lbQ3U497 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cd300lbQ3U497 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cd300lbQ3U497 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cd300lbQ3U497 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Cd300lbQ3U497 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Cd300lbQ3U497 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Cd300lbQ3U497 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Cd300lbQ3U497 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Cd300lbQ3U497 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Cd300lbQ3U497 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cd300lbQ3U497 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Cd300lbQ3U497 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Cd300lbQ3U497 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Cd300lbQ3U497 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Cd300lbQ3U497 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Cd300lbQ3U497 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Cd300lbQ3U497 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Cd300lbQ3U497 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,9■■□□□ 1,42
Cd300lbQ3U497 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Cd300lbQ3U497 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Cd300lbQ3U497 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Cd300lbQ3U497 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Cd300lbQ3U497 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Cd300lbQ3U497 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Cd300lbQ3U497 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Cd300lbQ3U497 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cd300lbQ3U497 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Cd300lbQ3U497 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Cd300lbQ3U497 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Cd300lbQ3U497 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Cd300lbQ3U497 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Cd300lbQ3U497 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Cd300lbQ3U497 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Cd300lbQ3U497 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Cd300lbQ3U497 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Cd300lbQ3U497 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Cd300lbQ3U497 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Cd300lbQ3U497 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Cd300lbQ3U497 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Cd300lbQ3U497 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Cd300lbQ3U497 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Cd300lbQ3U497 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Cd300lbQ3U497 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
Cd300lbQ3U497 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Cd300lbQ3U497 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Cd300lbQ3U497 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Cd300lbQ3U497 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Cd300lbQ3U497 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Cd300lbQ3U497 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Cd300lbQ3U497 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Cd300lbQ3U497 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Cd300lbQ3U497 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cd300lbQ3U497 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cd300lbQ3U497 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Cd300lbQ3U497 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Cd300lbQ3U497 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cd300lbQ3U497 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cd300lbQ3U497 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Cd300lbQ3U497 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Cd300lbQ3U497 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Cd300lbQ3U497 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,22
Cd300lbQ3U497 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Cd300lbQ3U497 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Cd300lbQ3U497 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Cd300lbQ3U497 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,58■■□□□ 1,21
Cd300lbQ3U497 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Cd300lbQ3U497 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Cd300lbQ3U497 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Cd300lbQ3U497 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
Cd300lbQ3U497 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cd300lbQ3U497 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Cd300lbQ3U497 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Cd300lbQ3U497 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Cd300lbQ3U497 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,39■■□□□ 1,17
Cd300lbQ3U497 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Cd300lbQ3U497 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Cd300lbQ3U497 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Cd300lbQ3U497 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Cd300lbQ3U497 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Cd300lbQ3U497 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Cd300lbQ3U497 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Cd300lbQ3U497 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Cd300lbQ3U497 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Cd300lbQ3U497 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Cd300lbQ3U497 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Cd300lbQ3U497 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Cd300lbQ3U497 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Cd300lbQ3U497 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Cd300lbQ3U497 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,01■■□□□ 1,11
Cd300lbQ3U497 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Cd300lbQ3U497 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Cd300lbQ3U497 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms