RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.43□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1B0GUT8 65 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A8MTW9 85 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HLA-DQA1P01909 254 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TCL1AP56279 114 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HBBP68871 147 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCNS1Q96KK3 526 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C7orf71A4D174 169 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H3BMM0 161 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRGC2P03986 189 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 S100A6P06703 90 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 STHQ8IWL8 128 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GTSF1Q8WW33 167 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FRZBQ92765 325 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL7A1Q02388 2944 aa5.41□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KNCNA6PVL3 124 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SNURFLB1AK76 121 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGKV3-20P01619 116 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OR5AL1P0C617 328 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MED14OSP0DP75 135 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CTRLP40313 264 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ASIPP42127 132 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DEFB1P60022 68 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RAB4BP61018 213 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TPPP3Q9BW30 176 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.4□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1B0GXF2 115 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 J3KRW8 73 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPINK4O60575 86 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLC6P0CF74 106 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GZMBP10144 247 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CACNG7P62955 275 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPINK13Q1W4C9 94 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TDRG1Q3Y452 100 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNLZQ5SXM8 178 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AMTNQ6UX39 209 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CNFNQ9BYD5 112 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NAGKQ9UJ70 344 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 M0R2Z0 102 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SNAI2O43623 268 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 INSP01308 110 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 APCSP02743 223 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CAMPP49913 170 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRR9Q5T870 116 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMEM136Q6ZRR5 245 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GATD1Q8NB37 220 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 U3KQK5 164 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CD7P09564 240 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRGC1P0CF51 173 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NTF3P20783 257 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TWIST1Q15672 202 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MUC21Q5SSG8 566 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZFP82Q8N141 532 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.37□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PHOX2AO14813 284 aa5.36□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HIST1H2BKO60814 126 aa5.36□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HIST1H2BJP06899 126 aa5.36□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms