RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569899.5

GDE1-205, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDE1, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-205ENST00000569899 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 ODF3Q96PU9 254 aa7.37□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 IL36BQ9NZH7 164 aa7.37□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 CXorf65A6NEN9 183 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 KLLNB2CW77 178 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 GPX1P07203 203 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 GZMBP10144 247 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 LEPP41159 167 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 FXYD7P58549 80 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 ELOBQ15370 118 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 LCE4AQ5TA78 99 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TUBA4BQ9H853 241 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.36□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 ANK2Q01484 3957 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 A0A1W2PPQ1 181 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 CXCL1P09341 107 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.35□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 C7orf71A4D174 169 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 S100PP25815 95 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 CDKN1BP46527 198 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 Q6AWC8 147 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 STHQ8IWL8 128 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TSKUQ8WUA8 353 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 NEU1Q99519 415 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 NAGKQ9UJ70 344 aa7.34□□□□□ -1.23
GDE1-205ENST00000569899 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 TMEM189A5PLL7 270 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 COLCA2A8K830 154 aa7.34□□□□□ -1.24
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GDE1-205ENST00000569899 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 DEFB125Q8N687 156 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 GTSF1Q8WW33 167 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 IMMP2LQ96T52 175 aa7.34□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 HIGD1CA8MV81 97 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 A8MWL6 223 aa7.33□□□□□ -1.24
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GDE1-205ENST00000569899 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 TSPOP30536 169 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 MUC21Q5SSG8 566 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.33□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 SPINK4O60575 86 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 ZNF575Q86XF7 245 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 NUP35Q8NFH5 326 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.32□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 FAM210BQ96KR6 192 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.31□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 XKRY2A2RUG3 117 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.3□□□□□ -1.24
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GDE1-205ENST00000569899 BTF3L4Q96K17 158 aa7.3□□□□□ -1.24
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GDE1-205ENST00000569899 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 XCL2Q9UBD3 114 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 FAM231BA6NCW3 169 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 B5MCH6 92 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 G3V4G9 280 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 H3BVH4 76 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 INSP01308 110 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 TYMSP04818 313 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 KRTAP10-11P60412 298 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.3□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 CTRLP40313 264 aa7.29□□□□□ -1.24
GDE1-205ENST00000569899 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.29□□□□□ -1.24
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