RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560353.1

APH1B-208, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-208ENST00000560353 TGFBR1P36897 503 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 NEDD8Q15843 81 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 REG3GQ6UW15 175 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 ZNF546Q86UE3 836 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.52□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 CENPXA8MT69 81 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 HPGDSO60760 199 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 CTF1Q16619 201 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 UBE2WQ96B02 151 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 RNF185Q96GF1 192 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 PRRT1Q99946 306 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 ZNF492Q9P255 531 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 KLK12Q9UKR0 248 aa6.51□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 FNDC10F2Z333 226 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 ZNF138P52744 262 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 ZNF266Q14584 549 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 ELOBQ15370 118 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 NIT1Q86X76 327 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 C7orf33Q8WU49 177 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.5□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 USP17L23D6RBM5 183 aa6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 PHOX2AO14813 284 aa6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 AGPAT2O15120 278 aa6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 Q0VG73 95 aa6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.49□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 A0A087WYN8 130 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 C5orf51A6NDU8 294 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 FAM25EA8MYX2 175 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 NDUFB4O95168 129 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 PRSS1P07477 247 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 HOXB5P09067 269 aa6.48□□□□□ -1.37
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APH1B-208ENST00000560353 DEFA3P59666 94 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 PDE6HQ13956 83 aa6.48□□□□□ -1.37
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APH1B-208ENST00000560353 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 A0A087WX48 190 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 AKAIN1P0CW23 69 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 Q6AWC8 147 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 Q6ZRG5 221 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 ATP5SQ99766 215 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 PSENENQ9NZ42 101 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.47□□□□□ -1.37
APH1B-208ENST00000560353 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 CTDSP2O14595 271 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 TAAR5O14804 337 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 GNRH2O43555 120 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 INPP1P49441 399 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 ZNF876PQ49A33 203 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 MZT2AQ6P582 158 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 Q8TAT8 98 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 NAGKQ9UJ70 344 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.46□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 LINC00862A6NCI5 91 aa6.45□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 PGPA6NDG6 321 aa6.45□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 GAGE12JA6NER3 117 aa6.45□□□□□ -1.38
APH1B-208ENST00000560353 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.45□□□□□ -1.38
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