RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	PCBD1	P61457	104 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	NCS1	P62166	190 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PLGLB1	Q02325	96 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	RHOH	Q15669	191 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC58	Q4VC31	144 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		Q6ZQY7	126 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	CLEC2B	Q92478	149 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	APC	P25054	2843 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MYH1	P12882	1939 aa		0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	PBRM1	Q86U86	1689 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125		A6NN06	94 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	NCR2	O95944	276 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	MT-ND4L	P03901	98 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TCRA	P04437	139 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	AKR1D1	P51857	326 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF137P	P52743	207 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	NEDD8	Q15843	81 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	OTOS	Q8NHW6	89 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGEF10	O15013	1369 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	USP24	Q9UPU5	2620 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ARAP1	Q96P48	1450 aa		0.41	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		0.4	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	DISP2	A7MBM2	1401 aa		0.4	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	SOGA1	O94964	1423 aa		0.4	□□□□□ -2.34
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0G2JMM0	328 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1B0GW64	132 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		K7ERU9	68 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CDC42EP2	O14613	210 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TPST1	O60507	370 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	APOC1	P02654	83 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TSPAN19	P0C672	248 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PDE6G	P18545	87 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SELENOW	P63302	87 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		Q5XG85	94 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		Q6ZS92	163 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TSC22D3	Q99576	134 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	BANF2	Q9H503	90 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		0.4	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NIN	Q8N4C6	2090 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	DLC1	Q96QB1	1528 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FAM92A	A1XBS5	289 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		A6NIN4	97 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	HIGD1C	A8MV81	97 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC179	H3BU77	68 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125		M0R2P5	195 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	NPFF	O15130	113 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	IGF2	P01344	180 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PRH1	P02810	166 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CD3D	P04234	171 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	IGLC6	P0CF74	106 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	PYY	P10082	97 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	FXYD6P3	P58550	94 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	COPZ1	P61923	177 aa		0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
MDM2-231	ENST00000544125	CLLU1	Q5K131	121 aa		0.39	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms