RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 ZMAT4Q9H898 229 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TMEM160Q9NX00 188 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.07□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 J3QKU1 62 aa7.06□□□□□ -1.28
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THBS3-211ENST00000541990 IGKCP01834 107 aa7.06□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.06□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 PPP1R27Q86WC6 154 aa7.06□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 ZNF479Q96JC4 524 aa7.06□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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THBS3-211ENST00000541990 C20orf78Q9BR46 151 aa7.06□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 NF1P21359 2839 aa7.06□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.05□□□□□ -1.28
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THBS3-211ENST00000541990 LMO4P61968 165 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 SPATA25Q9BR10 227 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TM2D2Q9BX73 214 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 HIGD1BQ9P298 99 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 PRO0461Q9UI25 63 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TNFRSF6BO95407 300 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 SCGB2A2Q13296 93 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 C12orf74Q32Q52 190 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 SFTA2Q6UW10 78 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 PRR25Q96S07 402 aa7.05□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TRGV3P03979 118 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 IGLC6P0CF74 106 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 MC5RP33032 325 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 PLGLAQ15195 96 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 LINC01548A6NM66 108 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 ERCC8Q13216 396 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 FHL3Q13643 280 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZQT7 251 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 ORM1P02763 201 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 CKS1BP61024 79 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 HES1Q14469 280 aa7.04□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TIMM23O14925 209 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 DPM2O94777 84 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 NDUFA3O95167 84 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 IGHG4P01861 327 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 PRAC2D3DTV9 90 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 F8W1H4 67 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 CNIH1O95406 144 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 AVPP01185 164 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 PIFOQ8TCI5 191 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 RPEQ96AT9 228 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.03□□□□□ -1.28
THBS3-211ENST00000541990 RNF223E7ERA6 249 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.02□□□□□ -1.29
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THBS3-211ENST00000541990 SPRY2O43597 315 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGLV1-47P01700 117 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 GAGE13Q4V321 117 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 GLMPQ8WWB7 406 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 HIST1H4GQ99525 98 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.02□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GWB2 263 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 RRN3P1Q2M238 152 aa7.01□□□□□ -1.29
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THBS3-211ENST00000541990 TMEM219Q86XT9 240 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PTH2Q96A98 100 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 GATA3P23771 443 aa7.01□□□□□ -1.29
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THBS3-211ENST00000541990 NFE4Q86UQ8 179 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 RNF182Q8N6D2 247 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 CFHR4Q92496 578 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 KLK15Q9H2R5 256 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.01□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LINC01546A6NGU7 62 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 MT-ATP8P03928 68 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 SYT8Q8NBV8 401 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 CDIP1Q9H305 208 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PDZD2O15018 2839 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 C10orf105Q8TEF2 133 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 DUX5Q96PT3 197 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 PRSS29PA6NIE9 313 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 NDPQ00604 133 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 TTC9CQ8N5M4 171 aa7□□□□□ -1.29
THBS3-211ENST00000541990 JMJD1CQ15652 2540 aa6.99□□□□□ -1.29
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