RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445969.1

GBP3-204, Transcript of guanylate binding protein 3, human

TSL 2

Gene GBP3, Length 411 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GBP3-204	ENST00000445969	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CRYGA	P11844	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CNTFR	P26992	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	DSCR10	P59022	87 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	HERVK_113	P63121	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	ZNF488	Q96MN9	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		U3KQK5	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		A0A096LNJ9	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		M0R135	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PEX7	O00628	323 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	IGKC	P01834	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	LEP	P41159	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PSMB2	P49721	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	SEC61G	P60059	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	TMEM258	P61165	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	FGF12	P61328	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		H0YGG7	62 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	DPM2	O94777	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	LTA	P01374	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		P01737	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CLPS	P04118	112 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	DEFA4	P12838	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CD52	P31358	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	UBE2D1	P51668	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	TRGV9	Q99603	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PRORY	Q9H606	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PTPRB	P23467	1997 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		A0A1B0GUT8	65 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CXCL13	O43927	109 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	ACYP1	P07311	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	COX7C	P15954	63 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	EBI3	Q14213	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	PRR4	Q16378	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		Q9H3A6	140 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969		Q9UF83	564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GBP3-204	ENST00000445969	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969		J3QLI3	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	SLC25A20	O43772	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969		P0DMU3	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GBP3-204	ENST00000445969	CRYGS	P22914	178 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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