RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CRYGSP22914 178 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPL22P35268 128 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 INSL3P51460 131 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AKR1D1P51857 326 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ERVS71-1P61550 626 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RPS28P62857 69 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FXYD3Q14802 87 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TAC4Q86UU9 113 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC00269Q8N2A0 174 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR51A4Q8NGJ6 313 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCL4L1Q8NHW4 92 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DYNLRB2Q8TF09 96 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 THEM6Q8WUY1 208 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC115Q96NT0 180 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PROK2Q9HC23 129 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BATF3Q9NR55 127 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OTORQ9NRC9 128 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SS18L2Q9UHA2 77 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KNTC1P50748 2209 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CACNA1CQ13936 2221 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RFX7Q2KHR2 1363 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 COL7A1Q02388 2944 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTPRFP10586 1907 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 E9PCH4 1651 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PIK3C2AO00443 1686 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZGRF1Q86YA3 2104 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BCL9O00512 1426 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD109Q6YHK3 1445 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FGD6Q6ZV73 1430 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KMT2DO14686 5537 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DLC1Q96QB1 1528 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NISCHQ9Y2I1 1504 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NINQ8N4C6 2090 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 J3KT08 172 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DEGS1O15121 323 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SNCGO76070 127 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGLV1-51P01701 117 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PRH1P02810 166 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MPC1LP0DKB6 136 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PYYP10082 97 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADCYAP1P18509 176 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DCDP81605 110 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LTC4SQ16873 150 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPANXN1Q5VSR9 72 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC25A26Q70HW3 274 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DEFB132Q7Z7B7 95 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SNX29P2Q8IUI4 249 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMIM20Q8N5G0 67 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C5orf56Q8N8D9 126 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OTOSQ8NHW6 89 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PYDC1Q8WXC3 89 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TCEAL4Q96EI5 215 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LINC00208Q96KT6 92 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AQP10Q96PS8 301 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NABP2Q9BQ15 211 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CBLN4Q9NTU7 201 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GINS2Q9Y248 185 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ABCA12Q86UK0 2595 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZFYVE9O95405 1425 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTPN13Q12923 2485 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SIP14410 1827 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PIEZO1Q92508 2521 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF462Q96JM2 2506 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1B0GW64 132 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 A0A1W2PRE2 83 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM14DPA8MWL7 114 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 M0R2Z0 102 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CSN2P05814 226 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SCTP09683 121 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HLA-DRB4P13762 266 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACYP2P14621 99 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 B2MP61769 119 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SPCS2Q15005 226 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms