RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 Q9H3A6 140 aa5.87□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.87□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.87□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 J3KRW8 73 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 CAMLGP49069 296 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 ESRGQ1W209 222 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 PATE2Q6UY27 113 aa5.86□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.86□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.86□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 TAS2R30P59541 319 aa5.85□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 GUK1Q16774 197 aa5.85□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 STX12Q86Y82 276 aa5.85□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.85□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 GGACTQ9BVM4 153 aa5.85□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 PRELID1Q9Y255 219 aa5.85□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.84□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.84□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 H3BTX0 84 aa5.84□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 ERVFC1-1P60608 527 aa5.84□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.84□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 ODF3Q96PU9 254 aa5.84□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.84□□□□□ -1.47
TROAP-208ENST00000548817 BIN3Q9NQY0 253 aa5.84□□□□□ -1.47
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TROAP-208ENST00000548817 HBG2P69892 147 aa5.83□□□□□ -1.48
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TROAP-208ENST00000548817 RHEBQ15382 184 aa5.83□□□□□ -1.48
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TROAP-208ENST00000548817 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.83□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.83□□□□□ -1.48
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TROAP-208ENST00000548817 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.83□□□□□ -1.48
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TROAP-208ENST00000548817 FUT9Q9Y231 359 aa5.83□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.83□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 A0A096LPF7 62 aa5.82□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 C7orf71A4D174 169 aa5.82□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.82□□□□□ -1.48
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TROAP-208ENST00000548817 GPX1P07203 203 aa5.82□□□□□ -1.48
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TROAP-208ENST00000548817 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.82□□□□□ -1.48
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TROAP-208ENST00000548817 LINC00477Q96M19 166 aa5.82□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 MGST2Q99735 147 aa5.82□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.82□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.82□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.82□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.81□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.81□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 H3BQ15 152 aa5.81□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 ZNF253O75346 499 aa5.81□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 IFNA1P01562 189 aa5.81□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 MT-ND4LP03901 98 aa5.81□□□□□ -1.48
TROAP-208ENST00000548817 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
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