RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251775.8

SNX4-201, Transcript of sorting nexin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX4, Length 2,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4-201ENST00000251775 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNX4-201ENST00000251775 TNFRSF6BO95407 300 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 MFAP4P55083 255 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 SMAGPQ0VAQ4 97 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 WFDC2Q14508 124 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 TTC9CQ8N5M4 171 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 FOXC2Q99958 501 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa14.64□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 IGHV3-23P01764 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 EBI3Q14213 229 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 CNFNQ9BYD5 112 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 IGLL5B9A064 214 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 DPM2O94777 84 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 BMI1P35226 326 aa14.63□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.63□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 F8W1H4 67 aa14.62□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 OOSP1A8MZH6 123 aa14.62□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.62□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 HLA-DRB4P13762 266 aa14.61□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 IGHG4P01861 327 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 SMPXQ9UHP9 88 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 HLA-DMBP28068 263 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 LINC01559Q495D7 138 aa14.6□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 TMEM160Q9NX00 188 aa14.59□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 Q8N9W7 124 aa14.59□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 C12orf74Q32Q52 190 aa14.58□□□□□ -0.07
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SNX4-201ENST00000251775 SPATA25Q9BR10 227 aa14.58□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.58□□□□□ -0.07
SNX4-201ENST00000251775 Q8N8P6 123 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 CTSGP08311 255 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 ETDBQ3ZM63 59 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 J3QR89 54 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 PPIFP30405 207 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 AGRNO00468 2067 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 TAL2Q16559 108 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 AMTNQ6UX39 209 aa14.56□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 EFNA4P52798 201 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 AKAP6Q13023 2319 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 NDUFS8O00217 210 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 PRO0461Q9UI25 63 aa14.55□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 UBE2E1P51965 193 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 ERCC8Q13216 396 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 ATP6V0BQ99437 205 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 LMO4P61968 165 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 MTURNQ8N3F0 131 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.54□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 C19orf84I3L1E1 186 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 SAA4P35542 130 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 TRGV3P03979 118 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 RRN3P1Q2M238 152 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 GAGE13Q4V321 117 aa14.53□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 A0A087WX48 190 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 A0A1B0GV72 72 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 PRAC2D3DTV9 90 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.52□□□□□ -0.08
SNX4-201ENST00000251775 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.52□□□□□ -0.08
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