RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040580.6

Syde1-201, Transcript of Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde1, Length 3,288 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1-201ENSMUST00000040580 P01726 129 aa14.71□□□□□ -0.05
Syde1-201ENSMUST00000040580 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rnf125Q9D9R0 233 aa14.71□□□□□ -0.05
Syde1-201ENSMUST00000040580 Esp6A8R0U0 136 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 MffQ6PCP5 291 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dirc2Q8BFQ6 478 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ifna6P07350 189 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr141Q60880 325 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr138Q7TRI7 312 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr476Q8VGI4 310 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mixl1Q9WUI0 231 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm29106A0A087WSP8 697 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cd209gD3Z5D4 194 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tspan15F7BWT7 294 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Hoxa1P09022 331 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 CortP56469 109 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 AgaQ64191 346 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Poc1aQ8JZX3 405 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rab40cQ8VHQ4 281 aa14.7□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ighv14-2A0A075B5R7 117 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ighv1-18A0A0A6YXN4 117 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Npffr1E9Q468 432 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ifna2P01573 190 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rpl8P62918 257 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Lrcol1Q3URS3 161 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Spsb3Q571F5 354 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Calm5Q6W3E0 140 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Il22ra2Q80XF5 230 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr816Q8VFU2 312 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr491Q8VG06 310 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trav6d-3A0A075B6B3 112 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm37388A0A0A6YY46 143 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr177E9Q7W1 309 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Prss2P07146 246 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ube2e1P52482 193 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trav6-3Q5R1E6 112 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr132Q7TRI8 313 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr1368Q8VFG3 314 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mogat1Q91ZV4 335 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ank2Q8C8R3 3898 aa14.69□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trav6d-5A0A075B6B9 112 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm3633L7N233 213 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm9611L7N476 213 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cd79bP15530 228 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dynlt3P56387 116 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Lyplal1Q3UFF7 239 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nol3Q9D1X0 220 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 9130008F23RikQ9D2Z6 181 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm12887B1AVM1 119 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fabp9O08716 132 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Chek1O35280 476 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Brs3O54798 399 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr1204Q7TR10 309 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Zfp459Q8BZ17 267 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fam216bQ8CC14 138 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr206Q8VGP9 306 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pygo1Q9D0P5 417 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 BC067074F6RXI4 2391 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ighv7-3A0A075B5R2 120 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Higd1cQ76I25 96 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr411Q7TRW8 315 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 4922502D21RikQ8C634 189 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm4763Q8CFJ5 196 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pxmp4Q9JJW0 212 aa14.68□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trav12d-1A0N8R0 115 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr513Q8VFZ3 309 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr639Q8VGY8 316 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tmem51Q99LG1 249 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 NagkQ9QZ08 343 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Chst4Q9R1I1 388 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 DeddQ9Z1L3 318 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fxyd1Q9Z239 92 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nav3Q80TN7 2359 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ighv1-58A0A075B5W9 117 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mmp27D3YV89 551 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tmem200bD3Z0P8 284 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr191L7N1Z8 309 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 P01803 113 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Spint3Q3UW09 88 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Elovl1Q9JLJ5 279 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tenm3Q9WTS6 2715 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm28285A0A087WQ54 102 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm21095A0A087WR14 222 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 G6pcP35576 357 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Defb30Q30KN4 75 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr1444Q8VFX2 319 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tmem50aQ9CXL1 157 aa14.67□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Usp9yF8VPU6 2556 aa14.66□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trav6-1A0A075B5Z8 112 aa14.66□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 PmchP56942 165 aa14.66□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Vdac2Q60930 295 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr1434Q7TQR9 312 aa14.66□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr112Q8C0S2 320 aa14.66□□□□□ -0.06
Syde1-201ENSMUST00000040580 Olfr860Q8VFF7 317 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.1 ms