RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001878.5

Hoxd12-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd12, Length 2,534 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Xrcc3Q9CXE6 349 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Sgms2Q9D4B1 365 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 PifoQ9D9W1 207 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Sfrp4Q9Z1N6 351 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cdc34bA0A140T8I4 237 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm5108J3QP01 101 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Klrd1O54707 179 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Zfp36l1P23950 338 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gnb2P62880 340 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Nkx3-1P97436 237 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr112Q8C0S2 320 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ido2Q8R0V5 405 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Scgb1b27Q91WB5 92 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem147Q9CQG6 224 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Foxj2Q9ES18 565 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ccl8Q9Z121 97 aa12.53□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Lce6aD3YV94 81 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 ApohQ01339 345 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rtl4Q3URY0 304 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 5730522E02RikQ5SP45 163 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Dlx1Q64317 255 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Megf10Q6DIB5 1147 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1356Q7TQU8 320 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 A730015C16RikQ8C992 119 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Zg16Q8K0C5 167 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Phf13Q8K2W6 296 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr344Q8VFP9 309 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr338Q8VGK6 306 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ms4a6cQ99N08 217 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Znf22Q9ERU3 237 aa12.52□□□□□ -0.4
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 4930444P10RikD3YUR1 185 aa12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P04942 107 aa12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm614Q3V2K1 191 aa12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Il22ra2Q80XF5 230 aa12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem170aQ9D342 144 aa12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trem3Q9JKE1 183 aa12.52□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 RelnQ60841 3461 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trav4-2A0A075B638 110 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tcrg-V4A0A0B4J1J8 138 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vmn1r224E9PWK2 298 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm10638F6QEG2 257 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tnfaip6O08859 275 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P04943 107 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Spata46Q4FZF2 204 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cdkn2aQ64364 169 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Bpifa5Q9CQX3 270 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem183Q9JJB9 375 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Supt4h1bQ9Z199 117 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm21882J3QN86 361 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rab33bO35963 229 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Hist1h1aP43275 213 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Dppa1Q810Y7 116 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rnf115Q9D0C1 305 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Usf3B2RUQ2 2221 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trav6d-3A0A075B6B3 112 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr284A0A0U1RP76 321 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Nxph4G3X9N5 304 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mtnd6P03925 172 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pla2g2cP48076 150 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trav6-3Q5R1E6 112 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr138Q7TRI7 312 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Q8CF25 301 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mrpl3Q99N95 348 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Sh2d6Q9D413 297 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Lypd8Q9D7S0 255 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Dopey1Q8BL99 2399 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem116A0A0G2JGD3 401 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm15128A2ADW8 449 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm15080A2BI02 449 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm15093A2BI72 449 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Luzp4B1AV09 449 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm15107B1B0X0 449 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm15097E9QA14 449 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P01759 136 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P01796 113 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P01797 113 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P01799 113 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Klk1b22P15948 259 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 CapgP24452 352 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 AmelxP63277 210 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pate4Q09098 99 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm15085Q62012 449 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ifna12Q80SS5 189 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem41bQ8K1A5 291 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1457Q8VFK3 317 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1339Q8VGB1 315 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cisd1Q91WS0 108 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mrpl42Q9CPV3 142 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem167aQ9CR64 72 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Kcnk5Q9JK62 502 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr709-ps1A0A140T8J9 307 aa12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Psg27Q497W2 474 aa12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Dmrtc2Q8CGW9 370 aa12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vmn1r225Q8R2A5 298 aa12.49□□□□□ -0.41
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr223Q8VF69 319 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.5 ms