RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		0.19	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615		H3BQV1	296 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MFSD11	O43934	449 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	SULT1C4	O75897	302 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CSN2	P05814	226 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FABP4	P15090	132 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PDE6G	P18545	87 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TAS2R41	P59536	307 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	QRFP	P83859	136 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	POU6F1	Q14863	301 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	C10orf111	Q8N326	155 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	STX19	Q8N4C7	294 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PLAC4	Q8WY50	150 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	BORCS8	Q96FH0	119 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MCEE	Q96PE7	176 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CACNA1A	O00555	2505 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RTL9	Q8NET4	1388 aa		0.18	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MYH3	P11055	1940 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A0J9YY99	117 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PIAS1	O75925	651 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TRAC	P01848	142 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FABP2	P12104	132 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	GLRX	P35754	106 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	LTC4S	Q16873	150 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	OTOR	Q9NRC9	128 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	COL6A3	P12111	3177 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	STAB1	Q9NY15	2570 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	SPTA1	P02549	2419 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		0.17	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ACACB	O00763	2458 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CAV3	P56539	151 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PRR15	Q8IV56	129 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ISOC1	Q96CN7	298 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	BIN3	Q9NQY0	253 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ACAN	P16112	2415 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCA1	O95477	2261 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCA4	P78363	2273 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	JMJD1C	Q15652	2540 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		0.16	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	CAD	P27708	2225 aa		0.15	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		0.15	□□□□□ -2.38
CBWD5-231	ENST00000495615	NCOR1	O75376	2440 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	PIK3C2A	O00443	1686 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM186A	A6NE01	2351 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	F8	P00451	2351 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	IGHV3-30	P01768	117 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	SERPINB1	P30740	379 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	NDUFA6	P56556	154 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		0.15	□□□□□ -2.39
CBWD5-231	ENST00000495615	XAF1	Q6GPH4	301 aa		0.15	□□□□□ -2.39

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