RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 CADP27708 2225 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.69□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 MYLKQ15746 1914 aa-0.7□□□□□ -2.52
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SENP6-210ENST00000487548 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
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SENP6-210ENST00000487548 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 NUP98P52948 1817 aa-0.7□□□□□ -2.52
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SENP6-210ENST00000487548 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 IDO1P14902 403 aa-0.7□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 EVI2AP22794 236 aa-0.7□□□□□ -2.52
SENP6-210ENST00000487548 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.7□□□□□ -2.52
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SENP6-210ENST00000487548 MUC17Q685J3 4493 aa-0.7□□□□□ -2.52
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SENP6-210ENST00000487548 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.73□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SENP6-210ENST00000487548 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SENP6-210ENST00000487548 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 BTF3L4Q96K17 158 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 ENY2Q9NPA8 101 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 ADCY9O60503 1353 aa-0.75□□□□□ -2.53
SENP6-210ENST00000487548 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.75□□□□□ -2.53
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