RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-209	ENST00000486016	NEDD8	Q15843	81 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	CASC2	Q6XLA1	102 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016		Q6ZQY7	126 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016		Q86TA4	180 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	ATOH7	Q8N100	152 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	CLEC2B	Q92478	149 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	PRELID3A	Q96N28	172 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	CCDC32	Q9BV29	185 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		0.36	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	PHGR1	C9JFL3	82 aa		0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	S100A5	P33763	92 aa		0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	NDUFA6	P56556	154 aa		0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	TEX29	Q8N6K0	151 aa		0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	CCL19	Q99731	98 aa		0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		0.35	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	PTPRD	P23468	1912 aa		0.34	□□□□□ -2.35
GCFC2-209	ENST00000486016	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		E7EQ34	232 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	PFDN1	O60925	122 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	FABP1	P07148	127 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	SPINT3	P49223	89 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	MAX	P61244	160 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	THEM6	Q8WUY1	208 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	MED31	Q9Y3C7	131 aa		0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	DLC1	Q96QB1	1528 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		A6NN06	94 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	IGHV3-30	P01768	117 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	PRH1	P02810	166 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	CCL4	P13236	92 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	ZNF137P	P52743	207 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	C10orf111	Q8N326	155 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	PLAC4	Q8WY50	150 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	NABP2	Q9BQ15	211 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	LXN	Q9BS40	222 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	SMPX	Q9UHP9	88 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		V9GYQ6	96 aa		0.33	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1B0GV72	72 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		H3BMG7	143 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	SULT1C4	O75897	302 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	FAM107A	O95990	144 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		Q6ZS92	163 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	MORN4	Q8NDC4	146 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	AP1S3	Q96PC3	154 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	CENPH	Q9H3R5	247 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	USP54	Q70EL1	1684 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	IFNA21	P01568	189 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	NEFH	P12036	1026 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	CRYGS	P22914	178 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	QRFP	P83859	136 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	CSAG1	Q6PB30	78 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	JPT1	Q9UK76	154 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		0.31	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	PBRM1	Q86U86	1689 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1W2PPB8	328 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016		A0A1W2PRS3	328 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	ARL5C	A6NH57	179 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	GYPB	P06028	91 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	SPTB	P11277	2137 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	SLC25A4	P12235	298 aa		0.3	□□□□□ -2.36
GCFC2-209	ENST00000486016	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	0.3	□□□□□ -2.36

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