RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.64□□□□□ -0.55
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CCNDBP1-201ENST00000300213 SCGB3A1Q96QR1 104 aa11.57□□□□□ -0.56
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CCNDBP1-201ENST00000300213 TM4SF5O14894 197 aa11.56□□□□□ -0.56
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CCNDBP1-201ENST00000300213 MDS2Q8NDY4 140 aa11.56□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0R381 172 aa11.56□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 CACNA1AO00555 2505 aa11.56□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6ZUT4 128 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 DTX2Q86UW9 622 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF182Q8N6D2 247 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.55□□□□□ -0.56
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
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