RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 F2Z2F3 143 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 OVOL1O14753 267 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CHEK1O14757 476 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 FABP4P15090 132 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PSMB8P28062 276 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ARL3P36405 182 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 LCN12Q6JVE5 192 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.8□□□□□ -1.48
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PACS1-211ENST00000531298 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GTSF1Q8WW33 167 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 LINC00477Q96M19 166 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 C17orf77Q96MU5 243 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 NIT2Q9NQR4 276 aa5.8□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CR1P17927 2039 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 LINC01548A6NM66 108 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
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PACS1-211ENST00000531298 TGFAP01135 160 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CTRLP40313 264 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 RAB4BP61018 213 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 SLC35B1P78383 322 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 TMEM219Q86XT9 240 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 BAGE3Q86Y29 109 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 BORCS7Q96B45 105 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 MYO18BQ8IUG5 2567 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 RELNP78509 3460 aa5.79□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 M0R3E3 92 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PRB1P04280 392 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GPX1P07203 203 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 OR5AL1P0C617 328 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 IGLC6P0CF74 106 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GZMBP10144 247 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PKIAP61925 76 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 SCGB2A2Q13296 93 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 Q5PR19 223 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PRR27Q6MZM9 219 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 REC114Q7Z4M0 266 aa5.78□□□□□ -1.48
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PACS1-211ENST00000531298 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 KCNS1Q96KK3 526 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 ODF3Q96PU9 254 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GNB4Q9HAV0 340 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PACS1-211ENST00000531298 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 TMEM189A5PLL7 270 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 SOCS3O14543 225 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 SERF1AO75920 110 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 PPBPP02775 128 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 MED14OSP0DP75 135 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 SRIP30626 198 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 CRIP1P50238 77 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 ZNF138P52744 262 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 TCL1AP56279 114 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 LINC00310P59036 64 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 BLCAPP62952 87 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 SLAQ13239 276 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 DEFB125Q8N687 156 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 MS4A10Q96PG2 267 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 NRN1Q9NPD7 142 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 RPH3ALQ9UNE2 315 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 S4R3C0 116 aa5.77□□□□□ -1.49
PACS1-211ENST00000531298 CREBBPQ92793 2442 aa5.76□□□□□ -1.49
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