RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GlrxQ9QUH0 107 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm16368A0A1Y7VNG9 144 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trav12d-1A0N8R0 115 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ap2s1P62743 142 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1168Q7TR25 312 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r26Q8R2D7 339 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nat8Q9JIY7 227 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Unc79Q0KK59 2596 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ighv1-20A0A0A6YX66 117 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4931422A03RikA2BHN9 113 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rps16P14131 146 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpl12P35979 165 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mex3bQ69Z36 601 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc36Q6PDM4 574 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tex13bQ99MW5 186 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrpl3Q99N95 348 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrps15Q9DC71 258 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr685A0A1L1SVG7 331 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm14408E9Q6B9 136 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01803 113 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ube2kP61087 200 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NfybP63139 207 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbpl2Q6SJ95 350 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1449Q8VEV8 314 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd5lQ9QWK4 352 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Oprk1P33534 380 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cpne2P59108 548 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf150Q5DTZ6 437 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Commd3Q63829 195 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd200r1lQ6XJV6 249 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr907Q7TRC7 310 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm9958Q8C9U4 106 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Neil3Q8K203 606 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mob3bQ8VE04 216 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr816Q8VFU2 312 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpusd4Q9CWX4 377 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usf3B2RUQ2 2221 aa23.2■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp109A0A0U1RPC5 652 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igkv4-51A0N8I8 119 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Npffr1E9Q468 432 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EcscrQ3TZW0 214 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr901Q7TRD1 311 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nxph3Q91VX5 252 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GrhprQ91Z53 328 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Csmd1Q923L3 3564 aa23.19■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd209gD3Z5D4 194 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr466E9Q2B9 308 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zc4h2Q68FG0 224 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chst4Q9R1I1 388 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm45871A0A1B0GRI9 540 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm2026A2ART4 498 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcnk15B2RVL1 343 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm4778L7N229 365 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ApohQ01339 345 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lcn3Q62471 182 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nhlh2Q64221 135 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dram1Q9DC58 238 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Timm23Q9WTQ8 209 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FlncQ8VHX6 2726 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm21778A0A087WNP8 232 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zdhhc22A0PK84 263 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pax1P09084 446 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hist1h1aP43275 213 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 KncnQ307W7 124 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pla2g16Q8R3U1 162 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa23.17■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ighv1-18A0A0A6YXN4 117 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm43191F6YIH5 235 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf5O35445 180 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P06335 190 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nudt10P0C027 164 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nudt11P0C028 164 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spsb3Q571F5 354 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CrygcQ61597 174 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Iba57Q8CAK1 358 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Angptl6Q8R0Z6 457 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 H2al3Q9D4U4 128 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fcrl6A1YIY0 268 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01881 257 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01882 290 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prss2P07146 246 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem88bQ3TYP4 173 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr136Q8VG72 312 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pygo1Q9D0P5 417 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp869Q9DC47 529 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clec6aQ9JKF4 209 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lgals9O08573 353 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hoxa1P09022 331 aa23.14■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr119Q7TQP3 335 aa23.14■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc20Q8CI70 184 aa23.14■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r222Q8R269 308 aa23.14■■□□□ 1.3
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr512Q8VFZ4 326 aa23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.5 ms