Protein–RNA interactions for Protein: Q63829

Commd3, COMM domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd3Q63829 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Commd3Q63829 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Commd3Q63829 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Commd3Q63829 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Commd3Q63829 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Commd3Q63829 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Commd3Q63829 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Commd3Q63829 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Commd3Q63829 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Commd3Q63829 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Commd3Q63829 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Commd3Q63829 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Commd3Q63829 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Commd3Q63829 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Commd3Q63829 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Commd3Q63829 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Commd3Q63829 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Commd3Q63829 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Commd3Q63829 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Commd3Q63829 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Commd3Q63829 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Commd3Q63829 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Commd3Q63829 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Commd3Q63829 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Commd3Q63829 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Commd3Q63829 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Commd3Q63829 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Commd3Q63829 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Commd3Q63829 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Commd3Q63829 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Commd3Q63829 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Commd3Q63829 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Commd3Q63829 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Commd3Q63829 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Commd3Q63829 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Commd3Q63829 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Commd3Q63829 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Commd3Q63829 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Commd3Q63829 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Commd3Q63829 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Commd3Q63829 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Commd3Q63829 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Commd3Q63829 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Commd3Q63829 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Commd3Q63829 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Commd3Q63829 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Commd3Q63829 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Commd3Q63829 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Commd3Q63829 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Commd3Q63829 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Commd3Q63829 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Commd3Q63829 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Commd3Q63829 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Commd3Q63829 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Commd3Q63829 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Commd3Q63829 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Commd3Q63829 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Commd3Q63829 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Commd3Q63829 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Commd3Q63829 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Commd3Q63829 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Commd3Q63829 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Commd3Q63829 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Commd3Q63829 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Commd3Q63829 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Commd3Q63829 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Commd3Q63829 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Commd3Q63829 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Commd3Q63829 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Commd3Q63829 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Commd3Q63829 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Commd3Q63829 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Commd3Q63829 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Commd3Q63829 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Commd3Q63829 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Commd3Q63829 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Commd3Q63829 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Commd3Q63829 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Commd3Q63829 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Commd3Q63829 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Commd3Q63829 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Commd3Q63829 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Commd3Q63829 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Commd3Q63829 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Commd3Q63829 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Commd3Q63829 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Commd3Q63829 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Commd3Q63829 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Commd3Q63829 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Commd3Q63829 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Commd3Q63829 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Commd3Q63829 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Commd3Q63829 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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