RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100497.10

Actb-201, Transcript of Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Actb, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Axon, Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Dendrite, Endoplasmic reticulum, Exosome, Growth cone, Lamellipodium, Perinuclear, Ribosome, Somatodendritic compartment .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr480Q8VEZ0 312 aa10.13□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr860Q8VFF7 317 aa10.13□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr508Q8VG42 310 aa10.13□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr961Q9EQ84 314 aa10.13□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Flg2Q2VIS4 2362 aa10.13□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Mgst2A2RST1 147 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Vmn1r224E9PWK2 298 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm21882J3QN86 361 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1329L7MTV4 313 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Tnfaip6O08859 275 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 P04942 107 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 P04943 107 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 LoxP28301 411 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gimap1P70224 277 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ldlrad2Q3V0V0 142 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ms4a13Q5FWC3 203 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1202Q8VF98 309 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1408Q8VG32 310 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Mus81Q91ZJ0 551 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Mrpl3Q99N95 348 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Mrpl41Q9CQN7 135 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem167aQ9CR64 72 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Hint2Q9D0S9 163 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ttc32Q9DAC7 148 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Spta1P08032 2415 aa10.12□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 1700015F17RikD3YUK8 150 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm20873J3QMQ9 232 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm20795J3QP49 232 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm21310J3QQ23 232 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Fut1O09160 376 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv3-6P18531 116 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 ApohQ01339 345 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm21440Q3TTD8 232 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gpr183Q3U6B2 357 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Rhox10Q4TU83 196 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1356Q7TQU8 320 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Aadacl4Q8BM81 407 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Lrrc20Q8CI70 184 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Commd9Q8K2Q0 198 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 RhovQ8VDU1 236 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Mrpl27Q99N92 148 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Tmem107Q9CPV0 140 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Hdhd3Q9CYW4 251 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 1700008P02RikQ9DAJ8 175 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf22Q9ERU3 237 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Slurp1Q9Z0K7 110 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Trbv12-2A0A0B4J1H1 124 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Igkv4-51A0N8I8 119 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ca2P00920 260 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 GzmfP08883 248 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Sssca1P56873 199 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Arrdc5Q497K5 325 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Rnf150Q5DTZ6 437 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr112Q8C0S2 320 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr976Q8VF15 326 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Sfxn4Q925N1 313 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Actl6bQ99MR0 426 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Bpifa5Q9CQX3 270 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Prr30Q9D9B7 401 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Fhl3Q9R059 289 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 G6pc2Q9Z186 355 aa10.11□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Pglyrp3A1A547 347 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Akirin2B1AXD8 201 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Mtco2P00405 227 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ly6c1P0CW02 131 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Oprk1P33534 380 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Igfbp1P47876 272 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ctdsp1P58466 261 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 CrygcQ61597 174 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 AgaQ64191 346 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1371Q7TQT7 311 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 PirtQ8BFY0 135 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Znf787Q8BIF9 381 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Zfp459Q8BZ17 267 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Nabp2Q8R2Y9 212 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Olfr1411Q8VFC4 323 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 FibinQ9CQS3 217 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Fam241aQ9CZL2 131 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Q9DAF8 208 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Try5Q9QUK9 246 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Try4Q9R0T7 246 aa10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Tagln2Q9WVA4 199 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 AtrxQ61687 2476 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa10.09□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm28171A0A087WQ19 227 aa10.09□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Ighv5-12-4A0A0A6YWG4 117 aa10.09□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Gm10638F6QEG2 257 aa10.09□□□□□ -0.79
Actb-201ENSMUST00000100497 Degs1O09005 323 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.4 ms