RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 UBBP0CG47 229 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 ARF6P62330 175 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CTAG1AP78358 180 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 BASP1P80723 227 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB119Q8N690 84 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 OR4E2Q8NGC2 313 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 FAM208BQ5VWN6 2430 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 SPTBN4Q9H254 2564 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 COL4A1P02462 1669 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 COL4A6Q14031 1691 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 GCC2Q8IWJ2 1684 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 LTN1O94822 1766 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 PRXQ9BXM0 1461 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 FREM1Q5H8C1 2179 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 DNAH12Q6ZR08 3092 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 OR5F1O95221 314 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 Q6Q795 121 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF826PQ6ZT77 177 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 OR5A1Q8NGJ0 315 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 RNF122Q9H9V4 155 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 OSTCQ9NRP0 149 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 ARL5AQ9Y689 179 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRC-212ENST00000491302 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM17P0DL12 118 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A40Q8TBP6 338 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 PHB2Q99623 299 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 PARVBQ9HBI1 364 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ENY2Q9NPA8 101 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 TPRP12270 2363 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 WNK3Q9BYP7 1800 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 PCDH15Q96QU1 1955 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 FAM159BA6NKW6 160 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ERP29P30040 261 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 RHEBQ15382 184 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01554Q52M75 96 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 SPANXN5Q5MJ07 72 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZQT0 140 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 OR11H6Q8NGC7 330 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 MON2Q7Z3U7 1717 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ECM29Q5VYK3 1845 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 REV3LO60673 3130 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 OR10X1Q8NGY0 326 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 OPTCQ9UBM4 332 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 C5P01031 1676 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 LY75O60449 1722 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK3Q8IZD9 2030 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 MBD5Q9P267 1494 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf16Q9BUW7 83 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 TJP1Q07157 1748 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ALS2Q96Q42 1657 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ACACBO00763 2458 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 HTTP42858 3142 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087X0T9 212 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 CRYGAP11844 174 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 LCA10Q71F78 164 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 GPR146Q96CH1 333 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 CEP19Q96LK0 163 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ARMC1Q9NVT9 282 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 XIRP2A4UGR9 3374 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 CDH23Q9H251 3354 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 NCOR1O75376 2440 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC37A2A6NM11 1700 aa2.79□□□□□ -1.96
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PTPRC-212ENST00000491302 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC141Q6ZP82 1450 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF609O15014 1411 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 NAIPQ13075 1403 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ALPK3Q96L96 1907 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 SHBGP04278 402 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 PRB1P04280 392 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF846Q147U1 533 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 PXT1Q8NFP0 134 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 FAM172AQ8WUF8 416 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINI1Q99574 410 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 MED9Q9NWA0 146 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 EPDR1Q9UM22 224 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 LMO7Q8WWI1 1683 aa2.78□□□□□ -1.96
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