RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C MNN11P46985 422 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C COQ6P53318 479 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TRS23Q03784 219 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C CIR2Q08822 631 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C FRE7Q12333 620 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C PIH1P38768 344 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C SSB2P40150 613 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C BUD17P53727 317 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YPL068CQ02749 293 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YDL073WQ07454 984 aa2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YMR084WA2P2R3 262 aa2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C WHI2P12611 486 aa2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C DUN1P39009 513 aa2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C VID28P40547 921 aa2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C BST1P43571 1029 aa2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C BPL1P48445 690 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C SAP4P53036 818 aa2.31□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C AQY1P0CD91 305 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C GSY2P27472 705 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C DHR2P36009 735 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C DID4P36108 232 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TDA10P42938 290 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C ENP2P48234 707 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C MFM1Q02783 413 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YCG1Q06680 1035 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TMA17Q12513 150 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C HMG2P12684 1045 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C EUG1P32474 517 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C CCL1P37366 393 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C EHT1P38295 451 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C RIM4P38741 713 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C EXO1P39875 702 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C NMD5P46970 1048 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YJR120WP47157 116 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YHM2Q04013 314 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C IRC3Q06683 689 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C GEP3Q08622 556 aa2.3□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TUF1P02992 437 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C BEM3P32873 1128 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C RPC34P32910 317 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YEL025CP39991 1188 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C PSA1P41940 361 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YFL015CP43578 164 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C FOL1P53848 824 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YPL216WQ08964 1102 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
HDA3YPR179C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C VPS33P20795 691 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C DAL3P32459 195 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C HXT4P32467 576 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C LOT5P34234 306 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TOM20P35180 183 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C RMA1P36001 430 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C APD1P38281 316 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C PAF1P38351 445 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C PEF1P53238 335 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TRE2Q08693 809 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data2.29□□□□□ -2.04not detected
HDA3YPR179C AIM41Q12032 185 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TGS1Q12052 315 aa2.29□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C MRC1P25588 1096 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YJU2P28320 278 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YBR071WP38243 211 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C DUG1P43616 481 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C ATG36P46983 293 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C STP1Q00947 519 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C IOC4Q04213 475 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C TDA9Q04545 1251 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C BSP1Q06604 576 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C PCL8Q08966 492 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C YLR111WQ12528 110 aa2.28□□□□□ -2.04
HDA3YPR179C RNR3P21672 869 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C RGT1P32862 1170 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SER1P33330 395 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YHR033WP38690 423 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YJL193WP39542 402 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C GPP2P40106 250 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C OPT1P40897 799 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C IRC5P43610 853 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SAE2P46946 345 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ATP23P53722 227 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C COG6P53959 839 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C RSC9Q03124 581 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ORM2Q06144 216 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C RMP1Q12530 201 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C AAC1P04710 309 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ATP12P22135 325 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C AEP2P22136 580 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ENP1P38333 483 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C NIT2P47016 307 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YNL092WP53934 400 aa2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C GFD1Q04839 188 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
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