RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	OMS1	Q06668	471 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	VHS3	Q08438	674 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	ACF2	Q12168	779 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	PEX1	P24004	1043 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SEC65	P29478	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SWI3	P32591	825 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	MOH1	P38191	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	RTT107	P38850	1070 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	VPS41	P38959	992 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SGO1	Q08490	590 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	HFI1	Q12060	488 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YOL087C	Q99247	1116 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SNF2	P22082	1703 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	PET127	P32606	800 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	NUF2	P33895	451 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	OAF3	P36023	863 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	DAS1	P47005	663 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	STB4	P50104	949 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	MRS2	Q01926	470 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TIM50	Q02776	476 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YHM2	Q04013	314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	VPS36	Q06696	566 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SIR3	P06701	978 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	DAL5	P15365	543 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	EUG1	P32474	517 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YPT7	P32939	208 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	OAR1	P35731	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YHL017W	P38745	532 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SFB3	P38810	929 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
SRC1	YML034W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	VPS72	Q03388	795 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YPS7	Q06325	596 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	THI22	Q06490	572 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	APM4	Q99186	491 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TOA1	P32773	286 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	FAT1	P38225	669 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TEL2	P53038	688 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	MCH5	Q08777	521 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SEC39	Q12745	709 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	IME1	P21190	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SEC6	P32844	805 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	RAV1	P47104	1357 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YGL082W	P53155	381 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	NFI1	Q12216	726 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	HIF1	Q12373	385 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TMA17	Q12513	150 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	RAD3	P06839	778 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	DAL3	P32459	195 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	PCL5	P38794	229 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	BIT61	P47041	543 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YJR120W	P47157	116 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	YAP1802	P53309	568 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	SSL2	Q00578	843 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	TIM44	Q01852	431 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	GYL1	Q04322	720 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	POM34	Q12445	299 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SRC1	YML034W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	BCS1	P32839	456 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	PHO11	P35842	467 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	PHO12	P38693	467 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	AIM20	P40451	204 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	STU2	P46675	888 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	FHN1	P53279	174 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	STP4	Q07351	490 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	RPN12	P32496	274 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	YBR071W	P38243	211 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	BIT2	P38346	545 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SRC1	YML034W	IES1	P43579	692 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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