RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		30.25	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	GAK	O14976	1311 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	CYP7A1	P22680	504 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	CACNB3	P54284	484 aa		30.24	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	30.24	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		30.23	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	30.23	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	DLK2	Q6UY11	383 aa		30.23	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	30.23	■■■□□ 2.43	1e-6	■■■□□ 18.8
GPS1-223	ENST00000584229	USP40	Q9NVE5	1235 aa		30.23	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	30.22	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		30.22	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	STAP2	Q9UGK3	403 aa		30.22	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	TNFAIP1	Q13829	316 aa		30.21	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		30.21	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		30.21	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		30.21	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	30.21	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		30.2	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	TNNI2	P48788	182 aa		30.2	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		30.2	■■■□□ 2.43
GPS1-223	ENST00000584229	IGSF3	O75054	1194 aa		30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	PDE6A	P16499	860 aa		30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	PDE4A	P27815	886 aa		30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	CDCA5	Q96FF9	252 aa		30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	PASK	Q96RG2	1323 aa		30.19	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	BAG3	O95817	575 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	FSD1	Q9BTV5	496 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		30.18	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		30.17	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	30.16	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	PICALM	Q13492	652 aa		30.16	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	RASA3	Q14644	834 aa		30.16	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		30.16	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	ADD2	P35612	726 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	APLP1	P51693	650 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	TCP10	Q12799	353 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	TEX11	Q8IYF3	940 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	RILPL2	Q969X0	211 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		30.14	■■■□□ 2.42
GPS1-223	ENST00000584229	MYH1	P12882	1939 aa		30.14	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	PLCG2	P16885	1265 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	NF2	P35240	595 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	NFIA	Q12857	509 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		30.13	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	EVI5L	Q96CN4	794 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	CNTNAP1	P78357	1384 aa		30.12	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	CHGB	P05060	677 aa		30.11	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	HSPA6	P17066	643 aa		30.11	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	RGS3	P49796	1198 aa		30.11	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	RHBDL3	P58872	404 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		30.1	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	PRKG1	Q13976	671 aa		30.09	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	UBE3C	Q15386	1083 aa		30.09	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	FAM83A	Q86UY5	434 aa		30.09	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	30.09	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	PPP4C	P60510	307 aa		30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	SKAP1	Q86WV1	359 aa		30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	CERS3	Q8IU89	383 aa		30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		30.08	■■■□□ 2.41
GPS1-223	ENST00000584229	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	USP5	P45974	858 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	CST9	Q5W186	159 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	FAM151A	Q8WW52	585 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	IDI2	Q9BXS1	227 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	30.07	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	MBD4	O95243	580 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	HTRA3	P83110	453 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	TTC22	Q5TAA0	569 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		30.06	■■■□□ 2.4
GPS1-223	ENST00000584229	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		30.06	■■■□□ 2.4

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