RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 PRR19A6NJB7 356 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-221ENST00000514231 ARNTP27540 789 aa9.58□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-221ENST00000514231 PDZD3Q86UT5 571 aa9.58□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4D-221ENST00000514231 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.58□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDE4D-221ENST00000514231 CEP44Q9C0F1 390 aa9.57□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 NBPF11Q86T75 865 aa9.54□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.53□□□□□ -0.88
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PDE4D-221ENST00000514231 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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