RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493315.1

WDPCP-217, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDPCP, Length 1,476 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-217ENST00000493315 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.24□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.24□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 APPBP2Q92624 585 aa9.24□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 LAMA4Q16363 1823 aa9.24□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 DOCK2Q92608 1830 aa9.24□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 M0R2C6 588 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 RPS6KB1P23443 525 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 PHKA1P46020 1223 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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WDPCP-217ENST00000493315 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 NLRP3Q96P20 1036 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.23□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 MYH13Q9UKX3 1938 aa9.23□□□□□ -0.93
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WDPCP-217ENST00000493315 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 CHRNDQ07001 517 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SMIM5Q71RC9 77 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 OSBP2Q969R2 916 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 NEK1Q96PY6 1258 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 AAASQ9NRG9 546 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 TAF1P21675 1872 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9.22□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 TRAK2O60296 914 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 ADD2P35612 726 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 FGD1P98174 961 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SPRYD7Q5W111 196 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 PI16Q6UXB8 463 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 SPATA5Q8NB90 893 aa9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
WDPCP-217ENST00000493315 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
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WDPCP-217ENST00000493315 CYP21A2P08686 494 aa9.21□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 MAP3K12Q12852 859 aa9.21□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.21□□□□□ -0.94
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WDPCP-217ENST00000493315 MCTP1Q6DN14 999 aa9.21□□□□□ -0.94
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WDPCP-217ENST00000493315 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.21□□□□□ -0.94
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WDPCP-217ENST00000493315 ST8SIA5O15466 376 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 TRIM37O94972 964 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 LARGE1O95461 756 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 APLP1P51693 650 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 PKP1Q13835 747 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 RASGRF1Q13972 1273 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 UBE4AQ14139 1066 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 UBE3CQ15386 1083 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 VPS37DQ86XT2 251 aa9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 CHD4Q14839 1912 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 COL4A1P02462 1669 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.19□□□□□ -0.94
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WDPCP-217ENST00000493315 PDE6AP16499 860 aa9.19□□□□□ -0.94
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WDPCP-217ENST00000493315 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 ME3Q16798 604 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 Q6ZUG5 572 aa9.19□□□□□ -0.94
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WDPCP-217ENST00000493315 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
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WDPCP-217ENST00000493315 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 MINPP1Q9UNW1 487 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.19□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF213O14771 459 aa9.18□□□□□ -0.94
WDPCP-217ENST00000493315 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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