RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 CAPN10Q9HC96 672 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.92□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 MAOBP27338 520 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.91□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-204ENST00000489160 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.91□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.91□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 NLRP12P59046 1061 aa7.9□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 CD163Q86VB7 1156 aa7.9□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 KRT82Q9NSB4 513 aa7.9□□□□□ -1.14
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CCL20-204ENST00000489160 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 GPRASP2Q96D09 838 aa7.89□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 USP21Q9UK80 565 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.88□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 SPATA32Q96LK8 384 aa7.88□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.87□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 MSTNO14793 375 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 F13A1P00488 732 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 ITGB2P05107 769 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 CTSBP07858 339 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 ARID5AQ03989 594 aa7.85□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 LRRC3Q9BY71 257 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 UBP1Q9NZI7 540 aa7.85□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 ZNF862O60290 1169 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 CILPO75339 1184 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 BPNT1O95861 308 aa7.84□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.84□□□□□ -1.15
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CCL20-204ENST00000489160 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 GMLQ99445 158 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.84□□□□□ -1.15
CCL20-204ENST00000489160 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.83□□□□□ -1.16
CCL20-204ENST00000489160 MEGF11A6BM72 1044 aa7.83□□□□□ -1.16
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