RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ABCB6Q9NP58 842 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 B3GALT4O96024 378 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 MAOBP27338 520 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 KCNA1Q09470 495 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 SGO2Q562F6 1265 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 PBRM1Q86U86 1689 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 GRIN2BQ13224 1484 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 TIAF1O95411 115 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 CD97P48960 835 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 FZD5Q13467 585 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 GRM2Q14416 872 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 RNF43Q68DV7 783 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 TGFB1P01137 390 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 DRD2P14416 443 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 USP11P51784 963 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PDE3AQ14432 1141 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 LCE1DQ5T752 114 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PI16Q6UXB8 463 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 RAD18Q9NS91 495 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 EEA1Q15075 1411 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 CTSBP07858 339 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ADH5P11766 374 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 FCGRTP55899 365 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 TREHO43280 583 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ECEL1O95672 775 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK8P45983 427 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PLCB3Q01970 1234 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 AP3B2Q13367 1082 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 NFKBIBQ15653 356 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 RAB6AP20340 208 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 GRIK1P39086 918 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 BCO2Q9BYV7 579 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 FAAP100Q0VG06 881 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 DSC3Q14574 896 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PAOXQ6QHF9 649 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 DYMQ7RTS9 669 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 FBXL6Q8N531 539 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 PRXQ9BXM0 1461 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS12P58397 1594 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 WDR64B1ANS9 1081 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 CUL7Q14999 1698 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 ASB16Q96NS5 453 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 ATG3Q9NT62 314 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 SYNJ2O15056 1496 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA3Q08378 1498 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-211ENST00000484135 CHD1O14646 1710 aa7.5□□□□□ -1.21
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