RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 KCNG4Q8TDN1 519 aa32.21■■■□□ 2.75
CERS1-201ENST00000429504 KINO60870 393 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
CERS1-201ENST00000429504 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
CERS1-201ENST00000429504 MYSM1Q5VVJ2 828 aa32.2■■■□□ 2.75
CERS1-201ENST00000429504 NACAP1Q9BZK3 213 aa32.2■■■□□ 2.75
CERS1-201ENST00000429504 PCDHA7Q9UN72 937 aa32.2■■■□□ 2.75
CERS1-201ENST00000429504 TAF1P21675 1872 aa32.2■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 TPM3P06753 285 aa32.2■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 ZNF165P49910 485 aa32.2■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 AKNAD1Q5T1N1 836 aa32.2■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 FSIP1Q8NA03 581 aa32.2■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 KRT23Q9C075 422 aa32.2■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 ZBTB43O43298 467 aa32.19■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa32.19■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 TMEM67Q5HYA8 995 aa32.19■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa32.19■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 LCORLQ8N3X6 602 aa32.18■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 DNAJC25Q9H1X3 360 aa32.18■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 LRP2BPQ9P2M1 347 aa32.18■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 TPM2P07951 284 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 STK38Q15208 465 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 ERFEQ4G0M1 354 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 STAG1Q8WVM7 1258 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 SENP2Q9HC62 589 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 ZSWIM5Q9P217 1185 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 NID2Q14112 1375 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 CTDSPL2Q05D32 466 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 MICU3Q86XE3 530 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 PIBF1Q8WXW3 757 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 CLIC4Q9Y696 253 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa32.17■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 CDC27P30260 824 aa32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 UBE4AQ14139 1066 aa32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 STX1AQ16623 288 aa32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 NFXL1Q6ZNB6 911 aa32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 MFSD6Q6ZSS7 791 aa32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 ALG1Q9BT22 464 aa32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 KIF28PB7ZC32 967 aa32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 TDO2P48775 406 aa32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 NTRK3Q16288 839 aa32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 MPNDQ8N594 471 aa32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 GJB4Q9NTQ9 266 aa32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 MTA3Q9BTC8 594 aa32.15■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 CACNA1SQ13698 1873 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 SPTLC2O15270 562 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 PRKAB2O43741 272 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 INCENPQ9NQS7 918 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 TACC3Q9Y6A5 838 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 COL24A1Q17RW2 1714 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA8AA7E2F4 631 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 RXRAP19793 462 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 SLC12A7Q9Y666 1083 aa32.14■■■□□ 2.74
CERS1-201ENST00000429504 STK36Q9NRP7 1315 aa32.14■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 C3orf67Q6ZVT6 689 aa32.13■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 VPS72Q15906 364 aa32.12■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 SLC10A5Q5PT55 438 aa32.12■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 ANO1Q5XXA6 986 aa32.12■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 IARSP41252 1262 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 MYH13Q9UKX3 1938 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 CCDC69A6NI79 296 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 SART3Q15020 963 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 AIFM3Q96NN9 605 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 BTAF1O14981 1849 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 CYP7A1P22680 504 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 IQCB1Q15051 598 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 KRT40Q6A162 431 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 PLA2G4DQ86XP0 818 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 VPS37DQ86XT2 251 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 PHKBQ93100 1093 aa32.11■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 MIGA1Q8NAN2 632 aa32.1■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 ANO10Q9NW15 660 aa32.09■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 GYG1P46976 350 aa32.09■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa32.09■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 MINPP1Q9UNW1 487 aa32.09■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 A0A1B0GVL5 298 aa32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 HSPA1LP34931 641 aa32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 ZNF75DP51815 510 aa32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 NDUFA8P51970 172 aa32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 CAVIN4Q5BKX8 364 aa32.08■■■□□ 2.73
CERS1-201ENST00000429504 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
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