RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 NLRP12P59046 1061 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 FBXW7Q969H0 707 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 BTG4Q9NY30 223 aa30.61■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 FAM177BA6PVY3 158 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 B4E1Z4 1266 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 PFKFB1P16118 471 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 FGFR2P21802 821 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 AK7Q96M32 723 aa30.6■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 GSDMDP57764 484 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 DPCR1Q3MIW9 517 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 KRT40Q6A162 431 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 TIGD1Q96MW7 591 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC69A6NI79 296 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 ZBTB43O43298 467 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 IMPACTQ9P2X3 320 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 SKILP12757 684 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 TPM4P67936 248 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 ARID5BQ14865 1188 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 SGMS1Q86VZ5 419 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 VPS37DQ86XT2 251 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF34Q8IZ26 560 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 JMYQ8N9B5 988 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 NKX2-3Q8TAU0 364 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 PPP6R2O75170 966 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 AIFM3Q96NN9 605 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXD13-201ENST00000392539 SLC5A1P13866 664 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 CDC27P30260 824 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 NFXL1Q6ZNB6 911 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 UBN2Q6ZU65 1347 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 SPATA5Q8NB90 893 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD7Q92527 254 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 LY9Q9HBG7 655 aa30.57■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 CCZ1BP86790 482 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 MICU3Q86XE3 530 aa30.56■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA8AA7E2F4 631 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 RXRAP19793 462 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 MAP3K12Q12852 859 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM29Q14134 588 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 SYCP1Q15431 976 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM67Q5HYA8 995 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 TIAM2Q8IVF5 1701 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 LIFRP42702 1097 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 NTRK3Q16288 839 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 PHKBQ93100 1093 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 SENP2Q9HC62 589 aa30.55■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 NBPF11Q86T75 865 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 IFNL3Q8IZI9 196 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 NAPBQ9H115 298 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 STK36Q9NRP7 1315 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 SYKP43405 635 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 CEP135Q66GS9 1140 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 CNNM2Q9H8M5 875 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 KCND1Q9NSA2 647 aa30.54■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 MAGEB6Q8N7X4 407 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 HPSEQ9Y251 543 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 PTPAQ15257 358 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC112Q8NEF3 446 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 ARID3AQ99856 593 aa30.53■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa30.52■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 BIN1O00499 593 aa30.52■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 MBD4O95243 580 aa30.51■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 PDCL2Q8N4E4 241 aa30.51■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 MAP3K14Q99558 947 aa30.51■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 KRT23Q9C075 422 aa30.51■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
HOXD13-201ENST00000392539 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 SLC12A7Q9Y666 1083 aa30.51■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 SLIT2O94813 1529 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 EXOC5O00471 708 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 IKBKBO14920 756 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 RASGRF1Q13972 1273 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 PTPN14Q15678 1187 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 NYAP1Q6ZVC0 841 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 TUBE1Q9UJT0 475 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 SMC2O95347 1197 aa30.5■■■□□ 2.47
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC150Q8NCX0 1101 aa30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms