RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDC25BP30305 580 aa12.33□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAGEA8P43361 318 aa12.33□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 WLSQ5T9L3 541 aa12.33□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 HDXQ7Z353 690 aa12.33□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 NCAPG2Q86XI2 1143 aa12.33□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXOC8Q8IYI6 725 aa12.33□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC151A5D8V7 595 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 AACSQ86V21 672 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 E2F5Q15329 346 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARL10Q8N8L6 244 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBXW7Q969H0 707 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP3K5Q99683 1374 aa12.32□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPRUQ92729 1446 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDKL5O76039 1030 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP85LQ5SZL2 805 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTC6Q86TZ1 520 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPAN18Q96SJ8 248 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAB11FIP3O75154 756 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRPHP41219 470 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP2R3AQ06190 1150 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC181Q5TID7 509 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TBC1D5Q92609 795 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RTEL1Q9NZ71 1219 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 USP31Q70CQ4 1352 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 LAMB3Q13751 1172 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLA2Q14181 598 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 BEND3Q5T5X7 828 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM71BQ8TC56 605 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMBR1Q8WVP7 490 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC2Q9BYS8 371 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 KCND1Q9NSA2 647 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLC4Q9NSK0 619 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 DACT1Q9NYF0 836 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAMM50Q9Y512 469 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 SSH2Q76I76 1423 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNRQ92752 1358 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 FNTAP49354 379 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 AFAP1L1Q8TED9 768 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 EHD4Q9H223 541 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 KDRP35968 1356 aa12.3□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TTC41PQ6P2S7 1318 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMOD2Q6P5Q4 547 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATL2Q8NHH9 583 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0D9SFI3 127 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF40O75150 1001 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUP133Q8WUM0 1156 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RABGGTAQ92696 567 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAPN15O75808 1086 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 JAK2O60674 1132 aa12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDHBP11177 359 aa12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TXLNAP40222 546 aa12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP3K9P80192 1104 aa12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 BRD3Q15059 726 aa12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRIM65Q6PJ69 517 aa12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP112Q8N8E3 955 aa12.28□□□□□ -0.44
APOBEC3C-201ENST00000361441 BCAS4Q8TDM0 211 aa12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms