RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 BIN1O00499 593 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 NCAPHQ15003 741 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 KIF18AQ8NI77 898 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM87BQ96K49 555 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 GREM2Q9H772 168 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.11■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 NRDCO43847 1150 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 SYKP43405 635 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 TMC6Q7Z403 805 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 NLRP10Q86W26 655 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 HPSEQ9Y251 543 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 KRT40Q6A162 431 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.1■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 ITGB4P16144 1822 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 DOCK2Q92608 1830 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.09■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 APPP05067 770 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 AIFM3Q96NN9 605 aa21.08■□□□□ 0.97
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB43O43298 467 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PDE6AP16499 860 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PTPAQ15257 358 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 OGFRQ9NZT2 677 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.08■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PDE8BO95263 885 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM29Q14134 588 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 MICU3Q86XE3 530 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 SYNE4Q8N205 404 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 ERO1AQ96HE7 468 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 STK36Q9NRP7 1315 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 B4E1Z4 1266 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 GPTP24298 496 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 SHC4Q6S5L8 630 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K14Q99558 947 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 STRN4Q9NRL3 753 aa21.07■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 CDC27P30260 824 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 FANCCQ00597 558 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 ALX1Q15699 326 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 RESP18Q5W5W9 173 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC102BQ68D86 513 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 NUP98P52948 1817 aa21.06■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 MYO1BO43795 1136 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 TUBB4AP04350 444 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 RXRAP19793 462 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 MYL5Q02045 173 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 NTRK3Q16288 839 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 HLFQ16534 295 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PIGBQ92521 554 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PHKBQ93100 1093 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 AIDAQ96BJ3 306 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 LY9Q9HBG7 655 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 CBFA2T2O43439 604 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 CUTAO60888 179 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.05■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 LIFRP42702 1097 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 PHKA1P46020 1223 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 EVA1CP58658 441 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.04■□□□□ 0.96
SPNS3-201ENST00000355530 NID2Q14112 1375 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms