RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317096.8

PARL-202, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-202ENST00000317096 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.22■■■□□ 2.27
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PARL-202ENST00000317096 IDH1O75874 414 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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PARL-202ENST00000317096 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.21■■■□□ 2.27
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PARL-202ENST00000317096 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.2■■■□□ 2.27
PARL-202ENST00000317096 CNTNAP1P78357 1384 aa29.2■■■□□ 2.26
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PARL-202ENST00000317096 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
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PARL-202ENST00000317096 MAP3K12Q12852 859 aa29.18■■■□□ 2.26
PARL-202ENST00000317096 SKAP1Q86WV1 359 aa29.18■■■□□ 2.26
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PARL-202ENST00000317096 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.16■■■□□ 2.26
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PARL-202ENST00000317096 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.15■■■□□ 2.26
PARL-202ENST00000317096 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.14■■■□□ 2.26
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PARL-202ENST00000317096 SULF1Q8IWU6 871 aa29.14■■■□□ 2.26
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PARL-202ENST00000317096 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.11■■■□□ 2.25
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PARL-202ENST00000317096 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
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PARL-202ENST00000317096 TTC22Q5TAA0 569 aa29.08■■■□□ 2.25
PARL-202ENST00000317096 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa29.07■■■□□ 2.24
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PARL-202ENST00000317096 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PARL-202ENST00000317096 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
PARL-202ENST00000317096 RGS3P49796 1198 aa29.06■■■□□ 2.24
PARL-202ENST00000317096 TNFAIP1Q13829 316 aa29.06■■■□□ 2.24
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PARL-202ENST00000317096 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.05■■■□□ 2.24
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PARL-202ENST00000317096 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
PARL-202ENST00000317096 ENTPD3O75355 529 aa29.04■■■□□ 2.24
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PARL-202ENST00000317096 LCORLQ8N3X6 602 aa29.04■■■□□ 2.24
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PARL-202ENST00000317096 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa29.03■■■□□ 2.24
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