RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297265.4

CHMP4C-201, Transcript of charged multivesicular body protein 4C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHMP4C, Length 1,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4C-201ENST00000297265 PTPDC1A2A3K4 754 aa16■□□□□ 0.15
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CHMP4C-201ENST00000297265 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
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CHMP4C-201ENST00000297265 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16■□□□□ 0.15
CHMP4C-201ENST00000297265 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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CHMP4C-201ENST00000297265 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16■□□□□ 0.15
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CHMP4C-201ENST00000297265 POLLQ9UGP5 575 aa15.97■□□□□ 0.15
CHMP4C-201ENST00000297265 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CHMP4C-201ENST00000297265 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.97■□□□□ 0.15
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CHMP4C-201ENST00000297265 FIBPO43427 364 aa15.97■□□□□ 0.15
CHMP4C-201ENST00000297265 APOA5Q6Q788 366 aa15.97■□□□□ 0.15
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CHMP4C-201ENST00000297265 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.95■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.95■□□□□ 0.14
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CHMP4C-201ENST00000297265 CD209Q9NNX6 404 aa15.95■□□□□ 0.14
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CHMP4C-201ENST00000297265 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.95■□□□□ 0.14
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CHMP4C-201ENST00000297265 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.95■□□□□ 0.14
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CHMP4C-201ENST00000297265 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.94■□□□□ 0.14
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CHMP4C-201ENST00000297265 TMEM67Q5HYA8 995 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 SP8Q8IXZ3 490 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 ELP1O95163 1332 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 USP17L12C9JPN9 530 aa15.93■□□□□ 0.14
CHMP4C-201ENST00000297265 USP17L21D6R901 530 aa15.93■□□□□ 0.14
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