RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612263.1

WHAMMP3-202, Transcript of WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules pseudogene 3, humanhuman

TSL 4

Gene WHAMMP3, Length 538 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3-202ENST00000612263 ABCA4P78363 2273 aa-0.28□□□□□ -2.45
WHAMMP3-202ENST00000612263 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.28□□□□□ -2.45
WHAMMP3-202ENST00000612263 COL24A1Q17RW2 1714 aa-0.28□□□□□ -2.45
WHAMMP3-202ENST00000612263 LAMC1P11047 1609 aa-0.28□□□□□ -2.45
WHAMMP3-202ENST00000612263 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
WHAMMP3-202ENST00000612263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-0.28□□□□□ -2.45
WHAMMP3-202ENST00000612263 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ERBINQ96RT1 1412 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SIP14410 1827 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 IGF2RP11717 2491 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 GADD45GO95257 159 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TTRP02766 147 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SULT1A1P50225 295 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 C8orf74Q6P047 294 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 C2orf82Q6UX34 121 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 KRT222Q8N1A0 295 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 GDPD1Q8N9F7 314 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PSMF1Q92530 271 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 C2orf50Q96LR7 162 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TP53RKQ96S44 253 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCDC90BQ9GZT6 254 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 KMT2AQ03164 3969 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.29□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CACNA1HO95180 2353 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 NEBP20929 6669 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PDZD2O15018 2839 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CHP2O43745 196 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 AHSA1O95433 338 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 IGLV1-51P01701 117 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 C1QBP02746 253 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SPRR2BP35325 72 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ZNF137PP52743 207 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ROMO1P60602 79 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 QRFPP83859 136 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 OR2T35Q8NGX2 323 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SLAMF6Q96DU3 332 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LYSMD1Q96S90 227 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 TMEM133Q9H2Q1 129 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RNF122Q9H9V4 155 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 JPT1Q9UK76 154 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 GUCA1BQ9UMX6 200 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ABCA12Q86UK0 2595 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FANCMQ8IYD8 2048 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SCN8AQ9UQD0 1980 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PKHD1P08F94 4074 aa-0.3□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 LY6G6CO95867 125 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCL4P13236 92 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CYBAP13498 195 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SPINT3P49223 89 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 DYNLT1P63172 113 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 C10orf99Q6UWK7 81 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 OR10AC1Q8NH08 325 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PPTC7Q8NI37 304 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PLAC4Q8WY50 150 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PROK2Q9HC23 129 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ASB4Q9Y574 426 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAT1Q14517 4588 aa-0.31□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 NCOR1O75376 2440 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 UNC13BO14795 1591 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 ARHGEF11O15085 1522 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 OBSL1O75147 1896 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 USP54Q70EL1 1684 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 A0A087WSZ3 146 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 A0A096LNT2 108 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 A6NN06 94 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 MT4P47944 62 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 AP3S2P59780 193 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 Q5BKY6 102 aa-0.32□□□□□ -2.46
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCDC122Q5T0U0 273 aa-0.32□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms