RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516123.1

SNORD116-28-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-28, humanhuman

BASIC

Gene SNORD116-28, Length 91 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-28-201ENST00000516123 YIPF3Q9GZM5 350 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 AICDAQ9GZX7 198 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PBOV1Q9GZY1 135 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 AK3Q9UIJ7 227 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 GNG8Q9UK08 70 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 FMN1Q68DA7 1419 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 RP1P56715 2156 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PTPRFP10586 1907 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TCHHQ07283 1943 aa0.7□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 MYOFQ9NZM1 2061 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 DSPPQ9NZW4 1301 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 LTBP2Q14767 1821 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PHIPQ8WWQ0 1821 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ERCC6Q03468 1493 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 NEO1Q92859 1461 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 WDR97A6NE52 1622 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 LTBP4Q8N2S1 1624 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 A0A0J9YX75 114 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SDHAF1A6NFY7 115 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TLCD2A6NGC4 264 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 B4DSR2 109 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SLC22A1O15245 554 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 IFNA10P01566 189 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 C1QCP02747 245 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF728P0DKX0 622 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 LINC00694P0DN24 101 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 BCL2P10415 239 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CRYGSP22914 178 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 KDELR1P24390 212 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PSMB8P28062 276 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 MPV17P39210 176 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SRP9P49458 86 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 AKR1D1P51857 326 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 DNAJB13P59910 316 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM258P61165 79 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 NCS1P62166 190 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 HBBP68871 147 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CCL20P78556 96 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 HOXC5Q00444 222 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 MYL5Q02045 173 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF117Q03924 483 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLCXD2Q0VAA5 305 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 KLRD1Q13241 179 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TAF9Q16594 264 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 RRN3P1Q2M238 152 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 DEFB134Q4QY38 66 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM155Q4W5P6 130 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 HSD17B12Q53GQ0 312 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CLLU1Q5K131 121 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 LCN15Q6UWW0 184 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 DPPA3Q6W0C5 159 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 BRD3OSQ6XYD6 125 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SNX29P2Q8IUI4 249 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CLECL1Q8IZS7 167 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 OR8A1Q8NGG7 326 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CANT1Q8WVQ1 401 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 ARL11Q969Q4 196 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TMEM106AQ96A25 262 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 C12orf57Q99622 126 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 RETNLBQ9BQ08 111 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 HSPB9Q9BQS6 159 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TM2D3Q9BRN9 247 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TAF9BQ9HBM6 251 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 BCL2L10Q9HD36 194 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CBLN4Q9NTU7 201 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TIMM9Q9Y5J7 89 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 COL4A2P08572 1712 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 CCDC88CQ9P219 2028 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SEC16AO15027 2179 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 SDK2Q58EX2 2172 aa0.69□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 MED12LQ86YW9 2145 aa0.68□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PLA2R1Q13018 1463 aa0.68□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 PTPRDP23468 1912 aa0.68□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.68□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRAV27A0A087WT01 109 aa0.68□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa0.68□□□□□ -2.3
SNORD116-28-201ENST00000516123 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102 ms