RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 A8MWL6 223 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 DEFB119Q8N690 84 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 NUP35Q8NFH5 326 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 RTTNQ86VV8 2226 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 MGST3O14880 152 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 LTAP01374 205 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ORM2P19652 201 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 C12orf74Q32Q52 190 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 DUX3Q96PT4 197 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 STARD5Q9NSY2 213 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 KNTC1P50748 2209 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1B0GXF2 115 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 TM4SF5O14894 197 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF138P52744 262 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.98□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ORM1P02763 201 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ACP1P24666 158 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 PPP1CAP62136 330 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 MFAP5Q13361 173 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 AGRNO00468 2067 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 NDUFA7O95182 113 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 IGKV1-39P01597 117 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 IGKV1D-39P04432 117 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 PIGCQ92535 297 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 DEPPQ9NTK1 212 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 GGTLC3B5MD39 225 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 EMP1P54849 157 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 IL11RAQ14626 422 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 C4orf26Q17RF5 130 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 FGF14Q92915 247 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM186AA6NE01 2351 aa8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 HERVK_113P63121 156 aa8.96□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 GNG5P63218 68 aa8.96□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 CST6Q15828 149 aa8.96□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.96□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 PROCRQ9UNN8 238 aa8.96□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa8.96□□□□□ -0.97
SEMA4B-204ENST00000558065 NKX2-2O95096 273 aa8.96□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 ST8SIA1Q92185 356 aa8.96□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 DHRS3O75911 302 aa8.96□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 CT62P0C5K7 136 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 COL8A2P25067 703 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 ASIPP42127 132 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 CAMPP49913 170 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 SHISA5Q8N114 240 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 SZT2Q5T011 3432 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 COL6A3P12111 3177 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 LINC00477Q96M19 166 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A0J9YW62 118 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 H0YGG7 62 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 RS1O15537 224 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 IGKV1-5P01602 117 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 CXCL10P02778 98 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 CCL1P22362 96 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM219Q86XT9 240 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 OR9G1Q8NH87 305 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 FZR1Q9UM11 496 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.95□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.94□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 Q5XG85 94 aa8.94□□□□□ -0.98
SEMA4B-204ENST00000558065 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms