RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476472.5

ANKRD28-209, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 594 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-209ENST00000476472 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 S1PR3Q99500 378 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 MDFIQ99750 246 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 EMC6Q9BV81 110 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 GNB4Q9HAV0 340 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 HIGD1BQ9P298 99 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RNF7Q9UBF6 113 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RNF114Q9Y508 228 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF236Q9UL36 1845 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.07□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 C2orf70A6NJV1 201 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 IGLL5B9A064 214 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 BUB3O43684 328 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 LYZL6O75951 148 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PTPRDP23468 1912 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 DYNLT1P63172 113 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM187Q14656 261 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TRNP1Q6NT89 227 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 NOXRED1Q6NXP6 359 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 C22orf39Q6P5X5 142 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PRR15Q8IV56 129 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TSKUQ8WUA8 353 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 FGF13Q92913 245 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 BORCS8Q96FH0 119 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 FMC1Q96HJ9 113 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PDFQ9HBH1 243 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RNF181Q9P0P0 153 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 V9GY05 133 aa3.06□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 MAST4O15021 2626 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RBAKDNA6NC62 111 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 H0Y8X5 98 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 J3QRE1 110 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 GASTP01350 101 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 HLA-DQA1P01909 254 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 CSN1S1P47710 185 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 UBE2E1P51965 193 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 CLDN17P56750 224 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 FBXW4P57775 412 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 SP4Q02446 784 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 EFEMP1Q12805 493 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 FOXF2Q12947 444 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 CDSNQ15517 529 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RTL8BQ17RB0 113 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 LCE1DQ5T752 114 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 NFE4Q86UQ8 179 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 AMN1Q8IY45 258 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 CEND1Q8N111 149 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 TMEM99Q8N816 258 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 C2orf48Q96LS8 159 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 LINC01600Q96MT4 127 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 KXD1Q9BQD3 176 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 STARD5Q9NSY2 213 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 PRR13Q9NZ81 148 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-209ENST00000476472 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms