RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002090.2

Ssr4-201, Transcript of Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ssr4, Length 765 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Sp6Q9ESX2 376 aa9.53□□□□□ -0.88
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Sh2d2aQ9QXK9 374 aa9.53□□□□□ -0.88
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Cldn10Q9Z0S6 231 aa9.53□□□□□ -0.88
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gm28778A0A087WSK7 233 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Trbv26A0A0B4J1P5 115 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gm5286E0CXI6 357 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Zfp493E9Q1L8 384 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gm11009F7CWA7 138 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gm21746J3QMM6 180 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Kcnk3O35111 409 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Ptpn20O55082 426 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 H2-Q10P01898 325 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 GzmaP11032 260 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Hsf1P38532 525 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 S100a3P62818 101 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gcm1P70348 436 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 PjvkQ0ZLH2 352 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 EcscrQ3TZW0 214 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Q3U595 105 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Srek1ip1Q4V9W2 153 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr1362Q5SZZ8 308 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Tgfbr2Q62312 592 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Vamp1Q62442 118 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr1219Q7TR04 311 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr58Q7TRF6 309 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Q80X32 188 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Lcn8Q924P3 175 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Rnaseh2cQ9CQ18 166 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Ssbp3Q9D032 388 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Mfsd4b2Q9D8I5 366 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Eif3fQ9DCH4 361 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Prss21Q9JHJ7 324 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Trem1Q9JKE2 230 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Rab25Q9WTL2 213 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Tex15F8VPN2 2785 aa9.52□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Ankrd60A2AMD2 318 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Ovol3D3YYM0 189 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Tnfaip6O08859 275 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 H2-M10.1O19443 331 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Lin7cO88952 197 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 P04943 107 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Svs5P30933 122 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 KrasP32883 189 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 FauP35545 74 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 OsmP53347 263 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gnb2P62880 340 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 ShbgP97497 403 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Trdv4Q5R1A3 115 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 DbpQ60925 325 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Sys1Q78S06 156 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Ifna13Q80SU4 189 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Fbxw26Q8BI58 466 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Nupl2Q8CIC2 420 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 TprkbQ8QZZ7 175 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr279Q8VFD8 310 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr303Q8VFP0 319 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr669Q8VGU9 317 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Rtn4ip1Q924D0 396 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Smim3Q99PE5 60 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Sapcd1Q9CY86 146 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Dph7Q9CYU6 477 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Klk4Q9Z0M1 255 aa9.51□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Rhox3gB9EJQ9 160 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr427E9Q7E7 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr906K7N5P3 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gm27021M0QWE2 156 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Klf9O35739 244 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 PomcP01193 235 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Cryba1P02525 198 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Hoxa3P02831 443 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Defa14P50712 85 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Lhx4P53776 390 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Esp1Q3LHH8 102 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Dirc2Q8BFQ6 478 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Znf146Q8BQN6 292 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Fam169bQ8CHT6 337 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Lyrm2Q8R033 88 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr492Q8VFD1 314 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Serpinb1bQ8VHP7 382 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Bcl7bQ921K9 202 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 GhsrQ99P50 364 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 H2afb1Q9CQ70 111 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Coa3Q9D2R6 108 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Abhd5Q9DBL9 351 aa9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 RbmxQ9WV02 391 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Trav5-4A0A075B652 114 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr1150-ps1A0A1L1STL1 316 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gm5089A1L3C8 106 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Gm5799E9Q2M1 201 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Mex3aG3UYU0 520 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Olfr467L7N455 308 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Rab18P35293 206 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Lmo4P61969 165 aa9.49□□□□□ -0.89
Ssr4-201ENSMUST00000002090 Clec12bQ149M0 275 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.6 ms