Protein–RNA interactions for Protein: P62818

S100a3, Protein S100-A3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100a3P62818 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
S100a3P62818 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
S100a3P62818 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
S100a3P62818 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
S100a3P62818 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
S100a3P62818 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
S100a3P62818 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
S100a3P62818 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
S100a3P62818 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
S100a3P62818 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
S100a3P62818 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
S100a3P62818 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
S100a3P62818 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
S100a3P62818 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
S100a3P62818 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
S100a3P62818 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
S100a3P62818 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
S100a3P62818 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
S100a3P62818 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
S100a3P62818 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
S100a3P62818 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
S100a3P62818 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
S100a3P62818 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
S100a3P62818 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
S100a3P62818 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
S100a3P62818 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
S100a3P62818 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
S100a3P62818 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
S100a3P62818 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
S100a3P62818 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
S100a3P62818 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
S100a3P62818 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
S100a3P62818 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
S100a3P62818 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
S100a3P62818 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
S100a3P62818 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
S100a3P62818 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
S100a3P62818 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
S100a3P62818 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
S100a3P62818 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S100a3P62818 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S100a3P62818 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
S100a3P62818 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
S100a3P62818 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
S100a3P62818 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
S100a3P62818 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
S100a3P62818 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
S100a3P62818 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
S100a3P62818 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
S100a3P62818 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
S100a3P62818 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
S100a3P62818 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
S100a3P62818 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
S100a3P62818 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
S100a3P62818 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
S100a3P62818 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
S100a3P62818 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
S100a3P62818 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
S100a3P62818 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
S100a3P62818 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
S100a3P62818 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
S100a3P62818 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
S100a3P62818 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
S100a3P62818 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
S100a3P62818 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100a3P62818 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
S100a3P62818 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
S100a3P62818 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
S100a3P62818 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
S100a3P62818 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
S100a3P62818 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100a3P62818 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
S100a3P62818 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
S100a3P62818 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S100a3P62818 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
S100a3P62818 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
S100a3P62818 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
S100a3P62818 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S100a3P62818 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S100a3P62818 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
S100a3P62818 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S100a3P62818 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S100a3P62818 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S100a3P62818 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
S100a3P62818 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
S100a3P62818 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
S100a3P62818 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
S100a3P62818 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
S100a3P62818 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
S100a3P62818 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
S100a3P62818 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
S100a3P62818 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S100a3P62818 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
S100a3P62818 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
S100a3P62818 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
S100a3P62818 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
S100a3P62818 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
S100a3P62818 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
S100a3P62818 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
S100a3P62818 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms