Protein–RNA interactions for Protein: Q924P3

Lcn8, Epididymal-specific lipocalin-8, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn8Q924P3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Lcn8Q924P3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Lcn8Q924P3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Lcn8Q924P3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Lcn8Q924P3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Lcn8Q924P3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Lcn8Q924P3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Lcn8Q924P3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Lcn8Q924P3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Lcn8Q924P3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Lcn8Q924P3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Lcn8Q924P3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Lcn8Q924P3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Lcn8Q924P3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Lcn8Q924P3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Lcn8Q924P3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Lcn8Q924P3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Lcn8Q924P3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Lcn8Q924P3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Lcn8Q924P3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Lcn8Q924P3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Lcn8Q924P3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Lcn8Q924P3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Lcn8Q924P3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Lcn8Q924P3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Lcn8Q924P3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Lcn8Q924P3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Lcn8Q924P3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Lcn8Q924P3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Lcn8Q924P3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Lcn8Q924P3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Lcn8Q924P3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Lcn8Q924P3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Lcn8Q924P3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Lcn8Q924P3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Lcn8Q924P3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Lcn8Q924P3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Lcn8Q924P3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Lcn8Q924P3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,7■■□□□ 1,54
Lcn8Q924P3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Lcn8Q924P3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Lcn8Q924P3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Lcn8Q924P3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Lcn8Q924P3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Lcn8Q924P3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Lcn8Q924P3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Lcn8Q924P3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Lcn8Q924P3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
Lcn8Q924P3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Lcn8Q924P3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Lcn8Q924P3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Lcn8Q924P3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Lcn8Q924P3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,48
Lcn8Q924P3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Lcn8Q924P3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Lcn8Q924P3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,19■■□□□ 1,46
Lcn8Q924P3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Lcn8Q924P3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Lcn8Q924P3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Lcn8Q924P3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Lcn8Q924P3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Lcn8Q924P3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Lcn8Q924P3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Lcn8Q924P3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Lcn8Q924P3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Lcn8Q924P3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Lcn8Q924P3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Lcn8Q924P3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Lcn8Q924P3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Lcn8Q924P3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Lcn8Q924P3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Lcn8Q924P3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Lcn8Q924P3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Lcn8Q924P3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Lcn8Q924P3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Lcn8Q924P3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Lcn8Q924P3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Lcn8Q924P3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Lcn8Q924P3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Lcn8Q924P3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Lcn8Q924P3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Lcn8Q924P3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Lcn8Q924P3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Lcn8Q924P3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Lcn8Q924P3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Lcn8Q924P3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Lcn8Q924P3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,59■■□□□ 1,37
Lcn8Q924P3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Lcn8Q924P3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Lcn8Q924P3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Lcn8Q924P3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Lcn8Q924P3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Lcn8Q924P3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Lcn8Q924P3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,46■■□□□ 1,35
Lcn8Q924P3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
Lcn8Q924P3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Lcn8Q924P3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Lcn8Q924P3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Lcn8Q924P3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Lcn8Q924P3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms