Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Rab18P35293 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab18P35293 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rab18P35293 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rab18P35293 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rab18P35293 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rab18P35293 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab18P35293 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rab18P35293 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rab18P35293 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rab18P35293 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rab18P35293 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rab18P35293 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rab18P35293 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab18P35293 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab18P35293 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab18P35293 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab18P35293 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab18P35293 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab18P35293 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab18P35293 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab18P35293 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab18P35293 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab18P35293 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rab18P35293 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rab18P35293 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab18P35293 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab18P35293 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab18P35293 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab18P35293 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab18P35293 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab18P35293 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab18P35293 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab18P35293 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab18P35293 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab18P35293 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab18P35293 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab18P35293 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab18P35293 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab18P35293 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab18P35293 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab18P35293 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab18P35293 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab18P35293 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab18P35293 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab18P35293 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab18P35293 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab18P35293 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab18P35293 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab18P35293 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab18P35293 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab18P35293 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab18P35293 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab18P35293 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rab18P35293 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab18P35293 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab18P35293 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab18P35293 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab18P35293 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab18P35293 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab18P35293 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab18P35293 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab18P35293 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab18P35293 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab18P35293 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab18P35293 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab18P35293 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab18P35293 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab18P35293 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab18P35293 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab18P35293 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab18P35293 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab18P35293 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab18P35293 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab18P35293 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab18P35293 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab18P35293 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab18P35293 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab18P35293 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab18P35293 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab18P35293 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab18P35293 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab18P35293 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab18P35293 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab18P35293 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab18P35293 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab18P35293 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rab18P35293 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rab18P35293 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rab18P35293 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab18P35293 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab18P35293 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab18P35293 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rab18P35293 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab18P35293 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rab18P35293 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab18P35293 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rab18P35293 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rab18P35293 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab18P35293 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms