Protein–RNA interactions for Protein: Q62312

Tgfbr2, TGF-beta receptor type-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr2Q62312 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Tgfbr2Q62312 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tgfbr2Q62312 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tgfbr2Q62312 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tgfbr2Q62312 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tgfbr2Q62312 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfbr2Q62312 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tgfbr2Q62312 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tgfbr2Q62312 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tgfbr2Q62312 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tgfbr2Q62312 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tgfbr2Q62312 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgfbr2Q62312 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tgfbr2Q62312 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgfbr2Q62312 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgfbr2Q62312 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tgfbr2Q62312 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tgfbr2Q62312 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tgfbr2Q62312 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tgfbr2Q62312 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tgfbr2Q62312 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tgfbr2Q62312 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tgfbr2Q62312 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tgfbr2Q62312 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfbr2Q62312 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tgfbr2Q62312 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tgfbr2Q62312 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tgfbr2Q62312 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgfbr2Q62312 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgfbr2Q62312 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tgfbr2Q62312 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tgfbr2Q62312 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tgfbr2Q62312 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tgfbr2Q62312 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tgfbr2Q62312 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tgfbr2Q62312 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tgfbr2Q62312 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfbr2Q62312 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tgfbr2Q62312 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tgfbr2Q62312 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tgfbr2Q62312 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tgfbr2Q62312 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tgfbr2Q62312 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfbr2Q62312 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tgfbr2Q62312 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfbr2Q62312 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfbr2Q62312 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfbr2Q62312 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfbr2Q62312 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfbr2Q62312 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfbr2Q62312 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfbr2Q62312 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfbr2Q62312 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tgfbr2Q62312 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tgfbr2Q62312 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tgfbr2Q62312 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tgfbr2Q62312 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfbr2Q62312 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfbr2Q62312 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tgfbr2Q62312 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tgfbr2Q62312 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tgfbr2Q62312 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgfbr2Q62312 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgfbr2Q62312 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tgfbr2Q62312 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tgfbr2Q62312 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tgfbr2Q62312 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfbr2Q62312 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tgfbr2Q62312 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tgfbr2Q62312 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tgfbr2Q62312 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfbr2Q62312 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tgfbr2Q62312 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tgfbr2Q62312 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgfbr2Q62312 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfbr2Q62312 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgfbr2Q62312 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgfbr2Q62312 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgfbr2Q62312 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgfbr2Q62312 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgfbr2Q62312 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgfbr2Q62312 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tgfbr2Q62312 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgfbr2Q62312 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgfbr2Q62312 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgfbr2Q62312 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgfbr2Q62312 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgfbr2Q62312 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tgfbr2Q62312 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgfbr2Q62312 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgfbr2Q62312 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgfbr2Q62312 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgfbr2Q62312 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgfbr2Q62312 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgfbr2Q62312 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgfbr2Q62312 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgfbr2Q62312 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgfbr2Q62312 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgfbr2Q62312 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgfbr2Q62312 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms