Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Srek1ip1Q4V9W2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Srek1ip1Q4V9W2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Srek1ip1Q4V9W2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Srek1ip1Q4V9W2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Srek1ip1Q4V9W2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Srek1ip1Q4V9W2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Srek1ip1Q4V9W2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Srek1ip1Q4V9W2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srek1ip1Q4V9W2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srek1ip1Q4V9W2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srek1ip1Q4V9W2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Srek1ip1Q4V9W2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Srek1ip1Q4V9W2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srek1ip1Q4V9W2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srek1ip1Q4V9W2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Srek1ip1Q4V9W2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Srek1ip1Q4V9W2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srek1ip1Q4V9W2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Srek1ip1Q4V9W2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Srek1ip1Q4V9W2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Srek1ip1Q4V9W2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Srek1ip1Q4V9W2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Srek1ip1Q4V9W2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srek1ip1Q4V9W2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Srek1ip1Q4V9W2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srek1ip1Q4V9W2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srek1ip1Q4V9W2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srek1ip1Q4V9W2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srek1ip1Q4V9W2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srek1ip1Q4V9W2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srek1ip1Q4V9W2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srek1ip1Q4V9W2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Srek1ip1Q4V9W2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srek1ip1Q4V9W2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srek1ip1Q4V9W2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srek1ip1Q4V9W2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srek1ip1Q4V9W2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Srek1ip1Q4V9W2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srek1ip1Q4V9W2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srek1ip1Q4V9W2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Srek1ip1Q4V9W2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srek1ip1Q4V9W2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Srek1ip1Q4V9W2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Srek1ip1Q4V9W2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srek1ip1Q4V9W2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Srek1ip1Q4V9W2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srek1ip1Q4V9W2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srek1ip1Q4V9W2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srek1ip1Q4V9W2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Srek1ip1Q4V9W2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Srek1ip1Q4V9W2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Srek1ip1Q4V9W2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Srek1ip1Q4V9W2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Srek1ip1Q4V9W2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Srek1ip1Q4V9W2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Srek1ip1Q4V9W2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Srek1ip1Q4V9W2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Srek1ip1Q4V9W2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srek1ip1Q4V9W2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srek1ip1Q4V9W2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srek1ip1Q4V9W2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srek1ip1Q4V9W2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srek1ip1Q4V9W2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srek1ip1Q4V9W2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srek1ip1Q4V9W2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srek1ip1Q4V9W2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srek1ip1Q4V9W2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srek1ip1Q4V9W2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srek1ip1Q4V9W2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms