RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466165.1

PRKRA-208, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, human

TSL 2

Gene PRKRA, Length 585 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKRA-208	ENST00000466165	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	TMEM230	Q96A57	120 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	TSC22D3	Q99576	134 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	SSX5	O60225	188 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	NUDT3	O95989	172 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	HBE1	P02100	147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	PTHLH	P12272	177 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	PPP5C	P53041	499 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	OR10A3	P58181	314 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	FABP5	Q01469	135 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165		Q9H8V8	135 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	FXYD7	P58549	80 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	SCGN	O76038	276 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	GNAO1	P09471	354 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165		U3KQE9	123 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PRKRA-208	ENST00000466165	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	RRN3P1	Q2M238	152 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	OR4A16	Q8NH70	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	CLN5	O75503	358 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	RLN1	P04808	185 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	RAB3B	P20337	219 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	SNCA	P37840	140 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	HERV-K104	P61576	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	DLK1	P80370	383 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	CLINT1	Q14677	625 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	GLMP	Q8WWB7	406 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	NRN1	Q9NPD7	142 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165		F5H768	121 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	FAM229A	H3BQW9	127 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	MYL9	P24844	172 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	SCN3B	Q9NY72	215 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165		Q9H3A6	140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	CORT	O00230	105 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	EREG	O14944	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	ZNF709	Q8N972	641 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	OR4X1	Q8NH49	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	PSG9	Q00887	426 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165		Q8WTZ3	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	MGLL	Q99685	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PRKRA-208	ENST00000466165	IFNA5	P01569	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PRKRA-208	ENST00000466165	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms