RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.09□□□□□ -0.31
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USP20-204ENST00000472108 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
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USP20-204ENST00000472108 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.08□□□□□ -0.32
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USP20-204ENST00000472108 CD81P60033 236 aa13.05□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 GNB1P62873 340 aa13.05□□□□□ -0.32
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USP20-204ENST00000472108 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.05□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 AKIRIN2Q53H80 203 aa13.05□□□□□ -0.32
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USP20-204ENST00000472108 RARRES2Q99969 163 aa13.05□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 VPS13CQ709C8 3753 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa13.04□□□□□ -0.32
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USP20-204ENST00000472108 HOXA5P20719 270 aa13.04□□□□□ -0.32
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USP20-204ENST00000472108 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 CSMD2Q7Z408 3487 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.04□□□□□ -0.32
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USP20-204ENST00000472108 IFNA1P01562 189 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 AKR1C3P42330 323 aa13.04□□□□□ -0.32
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USP20-204ENST00000472108 TREML4Q6UXN2 200 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 CTDSP1Q9GZU7 261 aa13.04□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 SMCO3A2RU48 225 aa13.03□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 TEX22C9J3V5 150 aa13.03□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 SOX15O60248 233 aa13.03□□□□□ -0.32
USP20-204ENST00000472108 MPDU1O75352 247 aa13.03□□□□□ -0.32
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