RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr918E9PVZ7 325 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm813Q3UWK9 176 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp948Q6DFU8 667 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Calm5Q6W3E0 140 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr702Q920Z2 318 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 1700029F12RikQ9CRB4 147 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Myo7bQ99MZ6 2113 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lef1P27782 397 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AregP31955 248 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 KrasP32883 189 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Efna2P52801 209 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Taar8bQ5QD06 344 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Reep5Q60870 185 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 FarsaQ8C0C7 508 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sft2d2Q8VD57 159 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mrps36Q9CQX8 102 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hs3st3b1Q9QZS6 390 aa23.44■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm43191F6YIH5 235 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr92L7N475 312 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 CrpP14847 225 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Clec12bQ149M0 275 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Slc7a15Q50E62 488 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Skida1Q80YR3 822 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Wdr82Q8BFQ4 313 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 ArsjQ8BM89 598 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm10600Q8BQ57 223 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr137Q8VFC2 312 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nxph3Q91VX5 252 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Icam4Q9ERM2 262 aa23.43■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ighv14-4A0A0A6YVR1 117 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm6665F6Y363 85 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pax1P09084 446 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 StomP54116 284 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Npas1P97459 594 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lyplal1Q3UFF7 239 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zic3Q62521 466 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1341Q7TQV4 312 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Pld4Q8BG07 503 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Bricd5Q8BV89 174 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr794Q8VF26 320 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rab40cQ8VHQ4 281 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sft2d3Q9CSV6 209 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Nova1Q9JKN6 507 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr117L7N1Z1 317 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 C1ql1O88992 258 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Kcnj3P63250 501 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 BC147527Q3V185 167 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Prss46Q5M8S2 314 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sirt7Q8BKJ9 402 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 BC049762Q8C601 163 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr130Q8VFC1 317 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Aifm1Q9Z0X1 612 aa23.42■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ncor1Q60974 2453 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm5890A0A140LI04 305 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 SdcbpO08992 299 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hsf1P38532 525 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr323Q5NCD0 323 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1002Q8VFK2 318 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr57Q8VGU7 319 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Srp19Q9D7A6 144 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 PyyQ9EPS2 98 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Arfgef3Q3UGY8 2170 aa23.41■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dchs1E9PVD3 3291 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Foxf2O54743 446 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cryba1P02525 198 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 OsmP53347 263 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ccl7Q03366 97 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cd200r1lQ6XJV6 249 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lhfpl1Q80SV1 220 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fam212bQ80VY2 300 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1297Q8VGE8 312 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 NgbQ9ER97 151 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 RprmQ9JJ72 109 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Myo9bQ9QY06 2114 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Trav5-1A0A075B5Z7 114 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fcer1gP20491 86 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Slc25a15Q9WVD5 301 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sumo3Q9Z172 110 aa23.4■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cd300lbQ3U497 209 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr484Q8VFD3 321 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1099Q8VG37 312 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr167Q8VGJ5 312 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr979Q8VH10 311 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 H1fooQ8VIK3 304 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sfxn3Q91V61 321 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Scrt1Q99M85 348 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa23.39■■□□□ 1.34
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ighv9-2A0A0B4J1J4 117 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr221B2RVX8 311 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1053L7MU59 313 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rpl29P47915 160 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm20816Q5FWD4 227 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sft2d1Q5SSN7 159 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cbln2Q8BGU2 224 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm3550W4VSN7 160 aa23.39■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr427E9Q7E7 315 aa23.38■■□□□ 1.33
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp58P16372 489 aa23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms