Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY06

Myo9b, Unconventional myosin-IXb, mousemouse

Predictions only

Length 2,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo9bQ9QY06 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,49■■■□□ 2,63
Myo9bQ9QY06 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Myo9bQ9QY06 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Myo9bQ9QY06 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Myo9bQ9QY06 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Myo9bQ9QY06 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,64■■■□□ 2,02
Myo9bQ9QY06 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Myo9bQ9QY06 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Myo9bQ9QY06 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Myo9bQ9QY06 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Myo9bQ9QY06 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Myo9bQ9QY06 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Myo9bQ9QY06 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Myo9bQ9QY06 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Myo9bQ9QY06 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Myo9bQ9QY06 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Myo9bQ9QY06 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Myo9bQ9QY06 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Myo9bQ9QY06 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Myo9bQ9QY06 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Myo9bQ9QY06 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Myo9bQ9QY06 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Myo9bQ9QY06 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Myo9bQ9QY06 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Myo9bQ9QY06 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Myo9bQ9QY06 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Myo9bQ9QY06 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Myo9bQ9QY06 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Myo9bQ9QY06 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Myo9bQ9QY06 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Myo9bQ9QY06 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Myo9bQ9QY06 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Myo9bQ9QY06 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Myo9bQ9QY06 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Myo9bQ9QY06 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Myo9bQ9QY06 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Myo9bQ9QY06 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Myo9bQ9QY06 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Myo9bQ9QY06 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Myo9bQ9QY06 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Myo9bQ9QY06 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Myo9bQ9QY06 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Myo9bQ9QY06 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Myo9bQ9QY06 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24,78■■□□□ 1,56
Myo9bQ9QY06 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Myo9bQ9QY06 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Myo9bQ9QY06 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Myo9bQ9QY06 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Myo9bQ9QY06 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Myo9bQ9QY06 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Myo9bQ9QY06 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Myo9bQ9QY06 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Myo9bQ9QY06 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Myo9bQ9QY06 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Myo9bQ9QY06 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Myo9bQ9QY06 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
Myo9bQ9QY06 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Myo9bQ9QY06 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Myo9bQ9QY06 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Myo9bQ9QY06 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Myo9bQ9QY06 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Myo9bQ9QY06 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Myo9bQ9QY06 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
Myo9bQ9QY06 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Myo9bQ9QY06 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Myo9bQ9QY06 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Myo9bQ9QY06 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Myo9bQ9QY06 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Myo9bQ9QY06 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Myo9bQ9QY06 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Myo9bQ9QY06 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Myo9bQ9QY06 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1,43
Myo9bQ9QY06 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Myo9bQ9QY06 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,91■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,89■■□□□ 1,42
Myo9bQ9QY06 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,89■■□□□ 1,41
Myo9bQ9QY06 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Myo9bQ9QY06 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Myo9bQ9QY06 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Myo9bQ9QY06 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Myo9bQ9QY06 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Myo9bQ9QY06 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Myo9bQ9QY06 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,66■■□□□ 1,38
Myo9bQ9QY06 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Myo9bQ9QY06 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Myo9bQ9QY06 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Myo9bQ9QY06 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Myo9bQ9QY06 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Myo9bQ9QY06 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Myo9bQ9QY06 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Myo9bQ9QY06 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Myo9bQ9QY06 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Myo9bQ9QY06 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Myo9bQ9QY06 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms