Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVR1

Ighv14-4, Immunoglobulin heavy variable 14-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ighv14-4A0A0A6YVR1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ighv14-4A0A0A6YVR1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighv14-4A0A0A6YVR1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv14-4A0A0A6YVR1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv14-4A0A0A6YVR1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighv14-4A0A0A6YVR1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms